高渗盐水诱导实验性青光眼模型中眼压升高影响的视网膜蛋白网络蛋白质组学鉴定

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD042729

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

眼压升高被认为是青光眼性视网膜神经变性的主要原因。为了更好地理解其潜在的分子过程和机制，我们报告了一项研究，聚焦于该疾病大鼠模型中诱导性高眼压所致视网膜蛋白质组的变化。通过向巩膜外静脉注射高渗盐水使眼房水流出通路硬化，从而模拟青光眼性病理过程。采用非标记鸟枪法策略的质谱定量视网膜蛋白质组学鉴定出200多种受高眼压显著影响的蛋白质。通过将研究结果组织为蛋白质相互作用网络并进行通路分析，揭示了青光眼病理生理学的多个方面。聚焦于视网膜神经变性这一该疾病的特征性过程，我们基于纳升液相色谱联用纳电喷雾电离串联质谱，采用数据采集的平行反应监测方法进行靶向蛋白质组学分析，验证了眼压升高诱导的选定蛋白质表达变化。

获取的原始数据通过提交至ProteomeXchange Consortium进行共享，首次公开了所选青光眼动物模型的视网膜蛋白质组学数据集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。