肺动脉高压患者血浆蛋白质组学数据

主题标签:肺动脉高压、血浆蛋白质组、循环系统疾病、蛋白质组学、PRIDE。本站分类:循环系统疾病/其他。本数据集为循环系统疾病领域公开数据集,主题涵盖肺动脉高压。

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蛋白质肺动脉高压血浆蛋白质组循环系统疾病蛋白质组学PRIDE
Plasma proteomics of patients with pulmonary arterial hypertension

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

肺动脉高压患者血浆蛋白质组学数据

Plasma proteomics of patients with pulmonary arterial hypertension 是一个面向循环系统疾病研究领域的公开蛋白质组学数据集,主题聚焦于肺动脉高压患者的血浆蛋白质组。该数据集由 Kirk Hansen 提交,收录于 EBI 旗下的 PRIDE 蛋白质组学数据存档平台,项目编号为 PXD083317。从主题构成看,数据集围绕肺动脉高压这一循环系统疾病,结合血浆样本与蛋白质组学技术,属于蛋白质组学与临床疾病研究交叉的公开数据资源。在分类上,该数据集归入循环系统疾病下的“其他”类别,适合作为肺动脉高压相关血浆蛋白研究的参考数据入口。整体而言,该数据集为研究者提供了一个可公开访问的血浆蛋白质组数据对象,其价值主要体现在肺动脉高压这一特定疾病背景下的血浆蛋白层面数据积累与共享。

【数据集背景】

肺动脉高压是一类以肺血管阻力升高为特征的循环系统疾病,涉及肺血管结构与功能的异常改变。血浆作为易于获取的体液样本,其蛋白质组成可在一定程度上反映机体在疾病状态下的系统性变化,因此血浆蛋白质组学被用于探索与疾病相关的蛋白标志物与病理机制。该数据集正是在这一研究背景下产生,将肺动脉高压患者与血浆蛋白质组学两个主题结合,归属于循环系统疾病领域的公开数据资源。数据集由 Kirk Hansen 作为提交者发布,依托 PRIDE 平台进行存档与共享,为肺动脉高压的血浆蛋白研究提供了可检索、可引用的数据对象。

【数据内容】

该数据集的主题标签涵盖肺动脉高压、血浆蛋白质组、循环系统疾病、蛋白质组学与 PRIDE。从名称与主题可以确定,其数据内容属于肺动脉高压患者血浆样本的蛋白质组学数据。关于具体的样本数量、蛋白鉴定数量、定量指标、实验分组以及数据文件类型等细节,源站未提供。因此,本数据集在内容层面的可确认信息限于其疾病主题、样本类型(血浆)与组学类型(蛋白质组学),更细粒度的数据构成需以源站记录为准。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体存档位置为 PRIDE 项目 PXD083317。提交者为 Kirk Hansen,提交年份在源站描述中记为 2026。数据集的来源站描述以标准数据集引用形式给出,包含提交者、年份、数据集标题与项目链接。关于样本采集地点、采集时间、临床信息来源、伦理审批信息以及仪器平台与实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题构成,该数据集可适用于肺动脉高压相关的血浆蛋白质组研究场景,例如作为疾病血浆蛋白数据的参考来源、用于蛋白质组学方法学比较的背景数据,或作为循环系统疾病蛋白质组数据整合与再利用的组成部分。由于数据集归属于循环系统疾病/其他类别,也可服务于该领域公开数据的编目、检索与共享实践。关于该数据集是否适用于特定类型的分析(如差异表达分析、标志物验证等),源站未提供明确说明,使用者应结合源站记录自行判断。

【使用方法】

该数据集通过 PRIDE 平台以项目编号 PXD083317 提供访问,使用者可依据源站给出的项目链接定位数据集记录。关于数据下载方式、文件格式、检索接口以及是否需要注册或遵守特定访问流程,源站未提供。使用前建议先查阅 PRIDE 项目页面上的元数据与文件说明,以确认数据组织方式与适用范围。

【质量与限制】

该数据集为公开存档的蛋白质组学数据对象,其质量相关信息(如数据完整性、鉴定置信度、定量重复性等)源站未提供。限制方面,可确认的信息仅覆盖疾病主题、样本类型与组学类型,缺少样本规模、实验设计、临床注释与分析结果等细节,因此在不查阅源站完整记录的情况下,难以对数据集的适用范围与结论强度作出判断。使用者应注意区分数据集标题所表达的主题范围与其实际数据覆盖范围。

【引用与许可】

引用信息可依据源站描述:Kirk Hansen (2026). Plasma proteomics of patients with pulmonary arterial hypertension [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD083317。关于该数据集的许可条款、使用限制与再分发条件,源站未提供。使用者在引用与再利用时应以源站记录中的许可与使用说明为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD083317

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Kirk Hansen (2026). Plasma proteomics of patients with pulmonary arterial hypertension [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD083317

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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