NHLBI TOPMed：动脉病遗传流行病学网络（GENOA）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/dbgap/phs001345

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数据说明

动脉病变遗传流行病学网络（GENOA）是NHLBI家庭血压计划（FBPP）四个网络之一。GENOA的长期目标是阐明高血压靶器官并发症的遗传学基础，包括累及心脏、脑、肾脏和外周动脉的动脉粥样硬化性和小动脉硬化性并发症。纵向GENOA研究招募了欧洲裔美国人和非洲裔美国人同胞家庭，每个家庭中至少有2名个体在60岁前被临床诊断为原发性高血压。无论高血压状态如何，同胞家庭中的所有其他成员均被邀请参与。参与者符合以下任一条件即被诊断为高血压：1）既往由医生临床诊断为高血压且目前正在接受抗高血压治疗；或2）就诊时第二次和第三次血压读数的平均收缩压≥140 mm Hg或舒张压≥90 mm Hg。仅非洲裔美国人队列的参与者通过TOPMed进行了测序。

家庭血压项目（FBPP）是GENOA的母项目，是一项前所未有的合作，旨在识别影响血压（BP）水平、高血压及其靶器官损害的基因。该项目已进行了超过21,000次体格检查，建立了一个包含数百项血压和高血压相关表型测量的共享数据库，完成了针对血压、高血压及高血压相关危险因素和并发症的全基因组连锁分析，并发表了130多篇关于项目发现的论文。FBPP最初是作为四个独立的研究者网络（HyperGEN、GenNet、SAPPHIRe和GENOA）获得资助的，这些网络在多个种族群体中竞相识别高血压的遗传决定因素。认识到通过合作取得成功的可能性更大，研究者们创建了一个单一的联盟，拥有项目范围和网络特定的

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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