瑞典儿童肿瘤生物样本库:瑞典所有儿童中枢神经系统及其他实体肿瘤的系统性收集与分子特征分析

该数据集包含82例儿童中枢神经系统及其他实体肿瘤样本及79例匹配外周血样本的全基因组和全外显子组测序数据,涵盖髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤、神经节胶质瘤等多种肿瘤类型,数据模态为基因组与表型组数据,主要用于儿童肿瘤的分子特征研究、病因机制探索、新治疗靶点发现以及精准医疗开发。

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2023-03-16 更新
儿童肿瘤基因组学精准医疗靶点发现
创建时间2023-03-16
更新时间2023-03-16
原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/The_Swedish_Childhood_Tumor_Biobank_Systematic_collection_and_molecular_characterization_of_all_pediatric_CNS_and_other_solid_tumors_in_Sweden/22249933

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资源简介

该数据集包含82例儿童中枢神经系统(CNS)肿瘤样本及79例匹配的外周血DNA样本的全基因组测序(WGS)和全外显子组测序(WES)数据。数据来源于瑞典儿童肿瘤生物样本库,涵盖髓母细胞瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤/原始神经外胚层肿瘤/胚胎性肿瘤、毛细胞星形细胞瘤、星形细胞瘤/胶质瘤、非典型畸胎样横纹肌样瘤、少突胶质细胞瘤、脑膜瘤、颅咽管瘤、松果体母细胞瘤、神经节胶质瘤、垂体腺瘤、脉络丛肿瘤和神经鞘瘤等多种儿童实体肿瘤。肿瘤DNA从新鲜冷冻组织中提取,匹配的正常DNA来自外周血细胞。测序文库构建和二代测序在瑞典斯德哥尔摩SciLifeLab的基因组生产中心完成,使用Illumina平台进行测序。该数据集通过FEGA瑞典节点提供受控访问,旨在支持儿童癌症的病因与机制研究、新治疗靶点发现及更有效疗法的开发。

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影像The Swedish Childhood Tumor Biobank: Systematic collection and molecular characterization of all pediatric CNS and other solid tumors in Sweden