博士论文第6章PRS补充材料数据集

本数据集包含博士论文《妊娠高血压疾病与晚年心血管疾病共享遗传风险位点的识别》的补充材料。该材料支撑第6章:妊娠高血压疾病(HDP)后心血管疾病(CVD)多基因风险评分(PRS)的遗传解析,重点分析来自PGS Catalog的现有CVD相关PRS,并检验它们在HDP-CAD(冠状动脉疾病)组之间是否存

University of TasmaniaUniversity of Tasmania
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基因组预测多基因风险评分心血管疾病妊娠高血压疾病PGS Catalog遗传变异BHS人群
Material from PhD thesis: Chapter 6 PRS Supplementary Files

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

博士论文第6章PRS补充材料数据集

本数据集为博士论文《妊娠高血压疾病与晚年心血管疾病共享遗传风险位点的识别》的补充材料,英文名称为“Material from PhD thesis: Chapter 6 PRS Supplementary Files”。该材料支撑论文第6章“妊娠高血压疾病(HDP)后心血管疾病(CVD)多基因风险评分(PRS)的遗传解析”,重点分析来自PGS Catalog的现有CVD相关PRS,并检验这些评分在HDP-CAD(冠状动脉疾病)组之间是否存在显著差异。数据集包含截至2024年1月3日PGS Catalog中1,022个CVD PRS的详细信息,以及一个女性特异性PRS子集,并收录了在BHS人群中与至少75%遗传变异匹配的PRS数量比较结果,以及在自助法95%置信区间后仍保持显著的PRS。该数据集由Gayathry Krishnamurthy与Phillip Melton撰写,机构为University of Tasmania,发布时间为2025年,来源站为doi.org,本站分类归入循环系统疾病/其他。

【数据集背景】

本数据集来源于一项博士论文研究,论文主题为识别妊娠高血压疾病与晚年心血管疾病之间的共享遗传风险位点。其第6章聚焦于妊娠高血压疾病后心血管疾病多基因风险评分的遗传解析。该章的核心工作是对来自PGS Catalog的现有CVD相关PRS进行分析,并检验这些PRS在HDP-CAD(冠状动脉疾病)组之间是否表现出显著差异。数据集作为该章节的补充材料,用于支撑上述分析的可重复性与透明度。

【数据内容】

数据集包含截至2024年1月3日PGS Catalog中1,022个CVD PRS的详细信息,并包含一个女性特异性PRS子集。此外,数据集还包含比较结果,即有多少PRS与BHS人群中至少75%的遗传变异相匹配。数据集亦收录了在自助法(bootstrapping)95%置信区间后仍保持显著的PRS,这些结果基于模型1(Models 1)的分析。源站描述在此处截断,模型1的完整定义及后续模型信息未完整给出。

【采集与来源】

数据集的PRS信息来源于PGS Catalog,时间节点为2024年1月3日。分析所涉及的群体为BHS人群。数据集本身作为博士论文第6章的补充文件发布,来源站为doi.org。作者为Gayathry Krishnamurthy与Phillip Melton,机构为University of Tasmania,发布时间为2025年。

【适用场景】

该数据集适用于围绕妊娠高血压疾病与心血管疾病之间遗传风险关联的研究场景,尤其是涉及多基因风险评分在HDP-CAD组间差异检验的分析。也可用于了解PGS Catalog中CVD相关PRS的覆盖情况、女性特异性PRS子集的构成,以及PRS在特定人群(如BHS人群)中的遗传变异匹配程度。此外,对于关注自助法置信区间后PRS显著性筛选的研究,该数据集提供了相应的补充结果。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。用户可依据数据集所包含的PRS列表、匹配结果及显著性筛选结果,结合自身研究目的进行二次分析或验证。由于数据集为补充材料,建议结合原博士论文第6章正文理解其分析框架与模型设定。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量与限制的专门说明。已知信息中,PRS信息截至2024年1月3日,具有明确的时间截面;匹配分析基于BHS人群,且以至少75%遗传变异匹配为阈值;显著性筛选基于自助法95%置信区间及模型1。源站描述在模型1处截断,后续模型及完整方法细节未给出,可能影响对结果的全面解读。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款。数据集作者为Gayathry Krishnamurthy与Phillip Melton,机构为University of Tasmania,发布时间为2025年,来源站为doi.org。建议用户在使用时参考原博士论文及来源站的相关说明。

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源站:https://doi.org/10.25959/5f60-5866

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含作为博士论文一部分的补充材料:妊娠期高血压疾病与晚年心血管疾病之间共享遗传风险位点的识别。该材料支持第六章:妊娠期高血压疾病(HDP)后心血管疾病(CVD)多基因风险评分(PRS)的遗传解析,该章重点分析来自PGS Catalog的现有CVD相关PRS,并检验它们在HDP-CAD(冠状动脉疾病)组之间是否存在显著差异。它包括截至2024年1月3日来自PGS Catalog的1,022个CVD PRS的详细信息,以及一个女性特异性PRS子集。该数据集包含比较与BHS人群中至少75%遗传变异匹配的PRS数量的结果。它还包括在岭回归后从模型1和模型2进行Bootstrap 95%置信区间后仍保持显著的PRS。ANOVA结果评估了在多重检验校正前后HDP-CAD类别之间的PRS差异,而逻辑回归汇总统计量则提供了有和无HDP的模型,分析它们与CAD的关联。

这些分析有助于理解连接HDP与晚年CVD的遗传风险因素,强调了PRS分层、性别特异性效应及统计显著性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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