Angiotensin II 输注 ApoE-/- 小鼠主动脉夹层而非腹主动脉瘤模型的影像数据集
数据集收录了该研究产生的影像文件,供在Mimics(Materialise,Leuven,Belgium)软件中打开使用

基本信息
资源简介
Angiotensin II 输注 ApoE-/- 小鼠主动脉夹层而非腹主动脉瘤模型的影像数据集
本数据集为一项发表于《Cardiovascular Research》2017年的研究论文配套影像数据,论文题为“Angiotensin II infusion into ApoE-/- mice: a model for aortic dissection rather than abdominal aortic aneurysm?”。数据集收录了该研究产生的影像文件,供在Mimics(Materialise,Leuven,Belgium)软件中打开使用。文件命名遵循“technique_id_timepoint_abd.mcs”的统一格式,其中technique代表成像技术,可为在体micro-CT或离体同步辐射PCXTM;id为实验期间使用的小鼠编号;timepoint对应四个可能的时间点之一。该数据集由Zenodo机构发布,发布时间为2019年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议。
【数据集背景】
该数据集服务于一项关于血管紧张素II输注ApoE-/-小鼠模型的研究,旨在探讨该模型更倾向于主动脉夹层而非腹主动脉瘤。研究论文于2017年发表在《Cardiovascular Research》上。数据集作为论文的补充材料,提供了研究中获取的影像文件,以便其他研究者查看、验证或复用。数据集所属分类为循环系统疾病/其他,来源站为doi.org。
【数据内容】
数据集包含的影像文件均为.mcs格式,需使用Mimics软件打开。文件命名规则为“technique_id_timepoint_abd.mcs”,其中technique表示成像技术,可为在体micro-CT或离体同步辐射PCXTM;id为实验期间使用的小鼠编号;timepoint表示时间点。小鼠被随机分配到两组(G1和G2),并在四个可能的时间点之一处死。时间点定义如下:TP0对应基线(Ang II输注前),TP1对应Ang II输注3天,TP2对应Ang II输注10天,TP3对应Ang II输注18天,TP4对应Ang II输注28天。PCXTM图像文件为离体成像。所有文件均以.abd.mcs为后缀。
【采集与来源】
数据来源于一项动物实验研究,使用ApoE-/-小鼠,接受Ang II输注。成像技术包括在体micro-CT和离体同步辐射PCXTM。小鼠被随机分为G1和G2两组,并在不同时间点处死以获取影像。数据集由Zenodo发布,来源站为doi.org。作者包括Trachet, Bram、Aslanidou, Lydia、Piersigilli, Alessandra、Fraga-Silva, Rodrigo、Sordet-Dessimoz, Jessica、Villanueva-Perez, Pablo、Stampanoni, Marco、Stergiopulos, Nikolaos、Segers, Patrick。机构为Zenodo。
【适用场景】
该数据集适用于血管疾病研究领域,特别是主动脉夹层和腹主动脉瘤的模型研究。研究人员可利用这些影像文件进行形态学分析、比较不同时间点的血管变化,或验证原论文的结论。由于文件需在Mimics中打开,适合具备该软件操作经验的研究者使用。此外,该数据集也可用于教学或方法学参考,展示在体micro-CT和离体同步辐射PCXTM在心血管研究中的应用。
【使用方法】
用户需使用Mimics(Materialise,Leuven,Belgium)软件打开所有.mcs文件。文件命名提供了关键信息:technique指示成像技术,id对应小鼠编号,timepoint指示时间点。用户可根据研究需要,筛选特定技术、小鼠编号或时间点的文件。例如,若关注Ang II输注28天后的变化,可选择TP4对应的文件。由于文件为影像数据,用户可进行三维重建、分割或定量分析。建议在使用前确认软件版本兼容性。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、分辨率、样本量或具体成像参数的信息。数据集仅包含影像文件,未提供原始数据、分析代码或统计结果。文件格式.mcs为专用格式,需依赖Mimics软件,可能限制部分用户的访问。此外,源站描述未提及数据是否经过预处理或标准化。用户需自行评估数据适用性。
【引用与许可】
数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议,允许共享、改编和商业使用,但需注明出处。引用时需遵循该许可要求,并参考原论文及数据集发布信息。作者列表和发布机构(Zenodo)应被正确引用。发布时间为2019年。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.2650189
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 49.57 GB。
数据说明
该数据集包含手稿《Angiotensin II infusion into ApoE-/- mice: a model for aortic dissection rather than abdominal aortic aneurysm?》的影像文件,该手稿于2017年发表在Cardiovascular Research上。所有已发表的文件均需在Mimics(Materialise, Leuven, Belgium)中打开。所有文件命名如下:“technique_id_timepoint_abd.mcs”。技术可以是体内微型CT,或离体同步辐射-based PCXTM。小鼠ID对应于实验中使用的ID。小鼠随机分为2组(G1和G2),并在4个可能的时间点之一后被处死。TP0对应基线(Ang II输注前),TP1对应Ang II输注3天,TP2对应Ang II输注10天,TP3对应Ang II输注18天,TP4对应Ang II输注28天。PCXTM的图像文件为离体,且始终对应于该动物微型CT可用的最新时间点。组织学数据以.zip格式存储,格式为.vsi。它们可以使用Olympus软件包OlyVIA打开,或使用开源软件包fiji的BIOP插件“vsi-reader”打开。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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