缺氧诱导的新生小鼠心脏来源成纤维细胞分泌组、外泌体及全细胞蛋白质组变化
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦新生小鼠心脏来源培养细胞在缺氧条件下成纤维细胞全细胞、外泌体及可溶性分泌组的蛋白质组变化

基本信息
资源简介
缺氧诱导的新生小鼠心脏来源成纤维细胞分泌组、外泌体及全细胞蛋白质组变化
该数据集聚焦于新生小鼠心脏来源培养细胞在缺氧条件下成纤维细胞全细胞、外泌体及可溶性分泌组的蛋白质组变化,英文名称为“Hypoxia-induced changes in the fibroblast secretome, exosome, and whole-cell proteome using cultured, cardiac-derived cells isolated from neonatal mice”。数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为蛋白质组学(Proteomics),在本站分类中归入循环系统疾病 / 其他。其核心内容围绕心脏成纤维细胞在缺氧刺激下三个层面的蛋白质组改变展开,即全细胞蛋白质组、外泌体蛋白质组以及可溶性分泌组蛋白质组,为研究缺氧对心脏成纤维细胞分泌功能与细胞整体蛋白表达的影响提供了组学层面的数据资源。
【数据集背景】
心脏成纤维细胞是心脏组织中的重要细胞类型,参与细胞外基质代谢、组织修复与纤维化等过程。缺氧是多种心脏病理状态(如缺血性损伤)中的常见微环境因素,可改变细胞的蛋白表达与分泌行为。该数据集以新生小鼠心脏来源的培养细胞为对象,针对缺氧条件下成纤维细胞的全细胞、外泌体及可溶性分泌组进行蛋白质组层面的观测,旨在刻画缺氧诱导的成纤维细胞分泌组与蛋白质组变化。数据集来源站 omicsdi.org 对其的描述为:涉及心脏成纤维细胞全细胞、外泌体及可溶性分泌组的蛋白质组变化。
【数据内容】
数据集涵盖三个相互关联的蛋白质组层面:一是全细胞蛋白质组,反映细胞整体蛋白表达状况;二是外泌体蛋白质组,反映由外泌体携带的蛋白成分;三是可溶性分泌组蛋白质组,反映细胞分泌到可溶性组分中的蛋白。三者共同构成对缺氧条件下心脏成纤维细胞蛋白表达与分泌特征的多层面描述。主题标签为蛋白质组学,表明数据主体为蛋白质组学实验所产生的数据。具体蛋白数量、差异蛋白列表、定量指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来自 omicsdi.org。研究对象为从新生小鼠心脏分离并培养的细胞,聚焦其中的成纤维细胞。实验条件涉及缺氧处理,并分别获取全细胞、外泌体与可溶性分泌组组分用于蛋白质组分析。样本量、培养条件细节、缺氧处理参数、分离与纯化方法、质谱平台与仪器型号等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心脏成纤维细胞生物学、缺氧应激响应、分泌组与外泌体研究以及蛋白质组学相关分析等场景。研究者可将其用于考察缺氧对心脏成纤维细胞全细胞蛋白表达的影响,比较外泌体与可溶性分泌组蛋白成分的变化,或作为相关组学研究的参照数据。由于涉及循环系统疾病分类,亦可服务于心脏病理机制探索中的组学数据整合与比较分析。具体应用方向需结合数据实际内容判断,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
使用时应区分全细胞、外泌体与可溶性分泌组三个数据层面,根据研究问题选择相应部分进行分析。由于涉及缺氧处理与对照比较,分析中需明确各组分的来源与处理背景。数据的具体格式、文件组织方式、定量矩阵结构、注释信息及配套分析工具等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于培养细胞模型,研究对象为新生小鼠心脏来源成纤维细胞,其结果向在体心脏组织或其他物种的外推需谨慎。数据仅覆盖蛋白质组层面,未涉及转录组、代谢组等其他组学信息。样本规模、重复数、定量精度、缺失值情况、批次效应及验证实验等信息,源站未提供,使用时应结合原始数据说明评估其适用性。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、作者信息、发表文献、版本信息及使用许可条款,源站未提供。使用与再分发前应向数据来源方核实相关要求。
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080038
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
与心脏成纤维细胞在全细胞、外泌体和可溶性分泌蛋白质组中蛋白质组变化相关的数据集。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




