GSE34205 儿童急性RSV与流感感染转录谱数据集
为研究急性 RSV 或流感感染患者的转录谱，经微生物学确诊后，邀请因急性 RSV 和流感病毒感染住院、中位年龄 2.4 个月（范围 1.5-8.6）的儿童参与研究入组
基本信息
资源简介
GSE34205 儿童急性RSV与流感感染转录谱数据集
GSE34205 数据集聚焦于急性呼吸道病毒感染的转录组研究，其核心目的是刻画急性 RSV（呼吸道合胞病毒）或流感病毒感染患者的基因表达谱。研究纳入经微生物学确诊、因急性 RSV 和流感病毒感染住院的儿童，中位年龄为 2.4 个月（范围 1.5-8.6），并在住院后 42-72 小时内采集血样用于转录谱分析。该数据集在本站归类于循环系统疾病 / 其他，来源站为 synapse.org，可为研究婴幼儿急性呼吸道病毒感染后的外周血转录响应提供样本层面的数据基础。
【数据集背景】
急性 RSV 与流感病毒感染是婴幼儿住院的常见原因，两者在临床表现上存在重叠，但宿主转录层面的应答差异值得关注。该数据集的设计初衷即为研究急性 RSV 或流感感染患者的转录谱，通过比较两类病毒感染儿童以及健康对照儿童的血样基因表达特征，为理解病毒感染后的宿主反应提供数据支持。研究对象为经微生物学确诊后受邀入组的住院儿童，入组时间为确诊之后，血样采集限定在住院后 42-72 小时内，以保证样本处于急性感染期。
【数据内容】
该数据集包含急性 RSV 感染队列、流感感染队列以及健康对照样本的转录谱数据。RSV 队列由 51 名患者组成，中位年龄 2 个月（范围 1.5-3.9）；流感队列由 28 名患者组成，中位年龄 5.5 个月（范围 1.4-21）。对照样本来自接受择期外科手术或门诊就诊的健康儿童。整体研究人群的中位年龄为 2.4 个月（范围 1.5-8.6）。除上述队列规模与年龄信息外，源站未提供具体的基因数量、检测平台、表达矩阵格式等细节。
【采集与来源】
样本为血液样本，采集时间窗为住院后 42-72 小时内。研究在微生物学确诊后邀请患者入组，并对入组人群设置了排除标准：疑似或已证实存在多种微生物混合感染的儿童、患有基础慢性疾病（如先天性心脏病、肾功能不全）的儿童、存在免疫缺陷的儿童，以及接受过全身性类固醇或其他免疫调节治疗的儿童均被排除。对照样本取自接受择期外科手术或在门诊就诊的健康儿童。数据来源站为 synapse.org。
【适用场景】
该数据集适用于研究婴幼儿急性 RSV 与流感病毒感染期间外周血的转录组特征，可用于比较两类病毒感染之间以及感染组与健康对照组之间的基因表达差异，也可用于探索与急性呼吸道病毒感染相关的宿主免疫应答模式。由于研究聚焦于住院儿童且设置了较严格的排除标准，数据可用于分析相对单纯的急性病毒感染场景，而不适用于合并基础疾病、免疫缺陷或混合感染人群的转录特征研究。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法以及分析工具等均未在现有信息中说明。使用者在利用该数据集时，需自行参考来源站 synapse.org 上的相关说明与配套文档。
【质量与限制】
该研究的样本采集限定在住院后 42-72 小时内，有助于保证急性期样本的一致性；入组时排除了混合感染、基础慢性疾病、免疫缺陷及接受免疫调节治疗的儿童，降低了混杂因素对转录谱的影响。限制方面，RSV 队列与流感队列的年龄分布存在差异（中位年龄分别为 2 个月和 5.5 个月），年龄因素可能在组间比较中产生影响；对照样本来自择期手术或门诊健康儿童，其采集背景与住院感染患儿不同。此外，源站未提供样本量之外的详细质控指标、数据完整性说明及批次信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn361580
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为研究急性RSV或流感感染患者的转录谱，对因急性RSV和流感病毒感染住院的中位年龄2.4个月（范围1.5-8.6）的儿童，在微生物学确诊后提供研究入组机会。在住院42-72小时内采集他们的血样。我们排除了疑似或证实有多微生物感染、有潜在慢性疾病（即先天性心脏病、肾功能不全）、有免疫缺陷，或接受过全身性类固醇或其他免疫调节治疗的儿童。RSV队列由51名中位年龄2个月（范围1.5-3.9）的患者组成，流感队列有28名中位年龄5.5个月（范围1.4-21）的患者。对照样本来自接受择期外科手术或门诊就诊的健康儿童。为排除病毒共感染，我们对所有受试者进行了鼻咽病毒培养。我们为RSV队列招募了10名中位年龄6.7个月（范围5-10）的对照患者，为流感队列招募了12名中位年龄18.5个月（范围10.5-26）的对照患者。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
