犬肺血管扩张与主动脉膨出血液甲基化-转录组整合分析数据集 [WGBS]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334621

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）数据，这些数据来自10只家犬的全血样本，这些犬具有影像学定义的心血管结构表型，包括肺血管扩张（PVE；n = 6）和主动脉膨出（AB；n = 4）。在相关研究中，这些表型相关病例组与69只对照犬进行了比较，以研究全基因组DNA甲基化改变，并识别与影像学心血管结构变化相关的候选差异甲基化区域（DMRs）。本GEO提交仅包含这10个表型相关病例样本的原始WGBS数据和经过处理的DNA甲基化谱；对照样本的原始测序数据未包括在内，因为它们是正在进行的研究的一部分。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。