犬慢性炎症性肠病与健康十二指肠黏膜单细胞RNA测序

该数据集来自 NCBI GEO(GSE254005),利用单细胞 RNA 测序对健康犬与慢性炎症性肠病(CIE)患犬的十二指肠组织进行异质性刻画

geo
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基因组分类GPL257609615
GSE254005: Single-Cell RNA Sequencing Investigation of the Duodenal Mucosa in Canine Chronic Inflammatory Enteropathy and Health

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

犬慢性炎症性肠病与健康十二指肠黏膜单细胞RNA测序

Single-Cell RNA Sequencing Investigation of the Duodenal Mucosa in Canine Chronic Inflammatory Enteropathy and Health

该数据集来自 NCBI GEO(GSE254005),利用单细胞 RNA 测序对健康犬与慢性炎症性肠病(CIE)患犬的十二指肠组织进行异质性刻画。数据覆盖十二指肠黏膜样本,包含 1 个文件(GSE254005_series_matrix.txt.gz),平台为 GPL25760,物种为犬(9615)。可用于比较健康与 CIE 状态下十二指肠细胞组成与表达差异,支持疾病相关细胞类型识别、表达谱分析与分类建模等研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 23 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们使用单细胞 RNA 测序来表征健康和慢性炎症性肠病(CIE)患犬十二指肠组织的异质性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL25760、9615。本站分类:消化系统疾病/炎症性肠病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE254005

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 31 202,引用时请注意版本时效。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们采用单细胞RNA测序技术,对健康和患有慢性炎症性肠病(CIE)的犬只十二指肠组织的异质性进行了表征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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