机械分离建立并维持心脏起搏细胞表型

该数据集来自 NCBI GEO(GSE320003),主题为机械分离建立并维持心脏起搏细胞表型,包含 1 个文件(GSE320003_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL34854,物种为 9031

geo
浏览 5
基因组分类GPL348549031
GSE320003: Mechanical Isolation Establishes and Maintains the Cardiac Pacemaker Cell Phenotype.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

机械分离建立并维持心脏起搏细胞表型

Mechanical Isolation Establishes and Maintains the Cardiac Pacemaker Cell Phenotype.

该数据集来自 NCBI GEO(GSE320003),主题为机械分离建立并维持心脏起搏细胞表型,包含 1 个文件(GSE320003_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL34854,物种为 9031。数据可用于研究机械转导通路异常激活对窦房结电功能的影响,以及细胞应变下离子通道系统和起搏细胞谱系相关转录因子网络的变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 19 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):窦房结(SAN)产生的电冲动负责心脏的节律性搏动。这些冲动由称为心脏起搏细胞(CPC)的特化心脏细胞产生。尽管控制 CPC 功能的离子机制已被研究了一个多世纪,但塑造和维持 SAN 独特电学特性的上游细胞事件仍未被充分理解。我们发现,CPC 内核心机械转导通路的异常激活会导致 SAN 中显著的电功能障碍。在机制上,我们的数据表明,对电振荡至关重要的整个离子通道系统,以及与 CPC 谱系定向相关的主要转录因子网络,在响应细胞应变时迅速下调。这些发现表明,机械解偶联和/或抑制

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34854、9031。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320003

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 03 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320003

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

窦房结(SAN)产生的电冲动负责心脏的节律性搏动。这些冲动由称为心脏起搏细胞(CPCs)的特化心脏细胞产生。尽管控制CPC功能的离子机制已被研究了一个多世纪,但塑造和维持SAN独特电生理特性的上游细胞事件仍未被充分理解。我们发现,CPC内核心机械转导通路的异常激活会导致SAN显著的電生理功能障碍。从机制上讲,我们的数据显示,对电振荡至关重要的整个离子通道系统,以及与CPC谱系定向相关的重大转录因子网络,在细胞应变作用下会迅速下调。这些发现表明,机械解偶联和/或机械转导信号通路的抑制作为一种此前未被认识的关键调控机制,对于支持心脏起搏是必要的。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。