Galnt1 是正常心脏瓣膜发育与心脏功能所必需的

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 PLOS ONE 2015 年论文,围绕 Galnt1 基因在心脏瓣膜发育与心脏功能中的作用

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2023-06-01 更新
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基因组idiopathic valve diseaseproteases ADAMTS 1bmpGalnt 1stage E 11.5.Cell proliferationfunctionExtracellular matrix proteinsheart valve developmentNormal Heart Valve Developmentmapkoutflow tract cushion
Galnt1 Is Required for Normal Heart Valve Development and Cardiac Function

基本信息

模态
基因组
大小
0.000487432 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

Galnt1 是正常心脏瓣膜发育与心脏功能所必需的

Galnt1 Is Required for Normal Heart Valve Development and Cardiac Function

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 PLOS ONE 2015 年论文,围绕 Galnt1 基因在心脏瓣膜发育与心脏功能中的作用。源站描述指出,Galnt1 缺失小鼠出现类似人类先天性心脏病的表型,包括主动脉瓣和肺动脉瓣狭窄与反流、射血分数改变及心脏扩张,其基础是流出道垫内细胞增殖增加导致瓣膜形成异常,最早在 E11.5 阶段检出。数据集含 3 个文件(S1_Table.xlsx、S2_Table.docx、S1_Fig.tif),可用于研究瓣膜发育、细胞增殖与细胞外基质相关机制(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Galnt1 Is Required for Normal Heart Valve Development and Cardiac Function》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0115861。源站首次发布:2015-01-23。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):人类先天性心脏瓣膜缺陷约发生于2%的活产儿中,是心脏功能受损的主要来源。在本研究中,我们证明正常心脏瓣膜发育和心脏功能依赖于Galnt1,该基因编码糖基转移酶(GalNAc-Ts)家族的一个成员,该家族负责启动粘蛋白型O-糖基化。在成年小鼠中,Galnt1缺失动物表现出模拟人类先天性心脏病的受损心脏功能,包括主动脉瓣和肺动脉瓣狭窄与反流、射血分数改变以及心脏扩张。其潜在表型是发育中心脏流出道垫内细胞增殖增加所致的瓣膜形成异常,该异常最早在发育阶段E11.5被检测到。来自Galnt1缺陷动物的发育中瓣膜显示红

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 487.43 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0115861。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:idiopathic valve disease、proteases ADAMTS 1、bmp、Galnt 1、stage E 11.5.、Cell proliferation、function、Extracellular matrix proteins、heart valve development、Normal Heart Valve Development。本站分类:循环系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Galnt1_Is_Required_for_Normal_Heart_Valve_Development_and_Cardiac_Function/1294060

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Tian, E; R. Stevens, Sharon; Guan, Yu; A. Springer, Danielle; A. Anderson, Stasia; F. Starost, Matthew; et al. (2016). Galnt1 Is Required for Normal Heart Valve Development and Cardiac Function. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "S1_Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1871801"
curl -L -o "S2_Table.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1871802"
curl -L -o "S1_Fig.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1871803"

文件清单

  • S1_Table.xlsx(46.65 KB)
  • S2_Table.docx(66.21 KB)
  • S1_Fig.tif(374.58 KB)

文件总体积 487.43 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

人类先天性心脏瓣膜缺陷约发生于2%的活产婴儿中,是导致心功能受损的主要原因之一。本研究证明,正常的心脏瓣膜发育和心脏功能依赖于Galnt1,该基因编码糖基转移酶家族(GalNAc-Ts)中的一个成员,该家族负责启动黏蛋白型O-糖基化。在成年小鼠中,Galnt1缺失动物表现出类似人类先天性心脏病的心功能受损,包括主动脉瓣和肺动脉瓣狭窄及反流、射血分数改变以及心脏扩张。其潜在表型为发育中心脏流出道垫内细胞增殖增加所致的瓣膜形成异常,该异常最早在发育阶段E11.5被检测到。Galnt1缺陷动物的发育中瓣膜显示蛋白酶ADAMTS1和ADAMTS5水平降低、蛋白聚糖versican的切割减少以及其他细胞外基质蛋白水平升高。我们还观察到BMP和MAPK信号传导增强。

综上所述,Galnt1的缺失似乎会破坏细胞外基质的形成/重塑,并改变调控细胞增殖的保守信号通路。我们的研究为这种保守的蛋白质修饰在心脏瓣膜发育中的作用提供了见解,并可能代表特发性瓣膜疾病的一种新模型。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0115861(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Galnt1_Is_Required_for_Normal_Heart_Valve_Development_and_Cardiac_Function/1294060)。

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