eMERGE网络难治性高血压研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/dbgap/phs000297

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

电子病历与基因组学（eMERGE）网络是由五个参与站点（西雅图团体健康、马什菲尔德诊所、梅奥诊所、西北大学和范德堡大学）组成的联盟，由NHGRI资助，旨在研究电子病历系统在基因组研究中的应用。eMERGE的目标是利用电子病历衍生的表型和来自关联生物样本库的DNA，在约19,000名个体中开展全基因组关联研究。该联盟采用电子表型分析方法，利用所有参与站点的DNA样本探索难治性高血压的遗传决定因素。难治性高血压是临床环境中的常见健康问题。难治性高血压的基本定义包括：使用三种降压药物后血压仍不受控的受试者，或需要四种及以上药物才能维持控制的受试者。其他情况，如高血压的继发性病因，则作为排除标准。

研究地点与参与者包括：范德堡大学：BioVU是范德堡大学的DNA数据库，为探索遗传变异、疾病易感性和药物反应差异之间关系提供了有利资源，是将基因组学和药物基因组学这两门新兴科学从研究工具转化为临床实践的关键第一步。BioVU从常规患者护理中收集的废弃血液样本中获取DNA。该生物样本库与从范德堡大学电子病历中提取的去识别化临床数据相关联，这些数据构成了基因型-表型关联中所用表型定义的基础。马什菲尔德诊所：马什菲尔德诊所个性化医学研究项目是位于威斯康星州中部的一个基于人群的生物样本库，拥有超过20，000名成年受试者，他们签署了书面知情同意书，同意研究者查阅其医疗记录，并提供了血液样本，从中提取了DNA，并储存了血浆和血清。此外，

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。