CAMUS 超声心动图图像分割数据集

该数据集源自 CAMUS 项目,提供经过处理的 HDF5 格式文件,便于初学者直接使用。原始数据为 2D 超声心动图图像,用于图像分割任务,涉及心脏结构识别

Toygar TanyelToygar Tanyel
google_dataset
2023-03-15 更新
浏览 3
医学影像图像分割heart conditionsimage segmentation
Echocardiography studies

基本信息

模态
医学影像
大小
2.123441736 GB
任务类型
图像分割
许可
Unknown
创建/更新时间
2023-03-15
版本
v1

资源简介

CAMUS 超声心动图图像分割数据集

Echocardiography studies 数据集源自 CAMUS 超声心动图图像分割项目,提供经过处理的 HDF5 格式数据文件,旨在降低初学者使用原始数据的门槛。该数据集在站内归入循环系统疾病 / 其他分类,来源于 kaggle.com,由 Toygar Tanyel 于 2023 年 3 月 15 日发布,版本为 v1。数据集仅包含一个文件 image_dataset.hdf5,合计约 2.12 GB,主题标签为心脏疾病与图像分割。原始数据为 2D 超声心动图图像,用于图像分割任务,涉及心脏结构识别。整体而言,该数据集适合作为超声心动图分割研究的入门数据资源,帮助使用者快速读取并接入后续分析流程。

【数据集背景】

该数据集对应 CAMUS 超声心动图图像分割数据集(CAMUS echocardiographic image segmentation dataset),是 CAMUS 项目数据的处理后版本。源站说明指出,CAMUS 项目原始发布版本对初学者而言较难处理,因此该数据集提供了经过处理的 HDF5 数据文件,以便直接使用。CAMUS 项目本身是一个开放的大规模 2D 超声心动图数据集,相关成果发表于 IEEE Transactions on Medical Imaging 的论文《Deep Learning for Segmentation using an Open Large-Scale Dataset in 2D Echocardiography》。该数据集在站内被归入循环系统疾病 / 其他分类,主题标签包括心脏疾病和图像分割。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 image_dataset.hdf5,格式为 HDF5,合计约 2.12 GB。数据内容为 2D 超声心动图图像,面向图像分割任务,涉及心脏结构识别。源站未提供具体的样本数量、图像尺寸、标注类别、字段结构或数据划分等细节。

【采集与来源】

数据来源于 CAMUS 项目。源站给出了原始数据集与项目页面地址,并提供了示例 GitHub 仓库链接。该数据集由 Toygar Tanyel 发布在 kaggle.com,发布时间为 2023 年 3 月 15 日,版本为 v1。源站未提供具体的采集设备、采集地点、采集时间范围或受试者信息。

【适用场景】

该数据集适用于 2D 超声心动图图像分割相关任务,尤其是心脏结构识别方向的研究与练习。由于其提供的是经过处理的 HDF5 文件,适合初学者直接读取使用,也可作为深度学习分割模型的训练或验证数据来源。源站未提供其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 image_dataset.hdf5,合计约 2.12 GB,并按 HDF5 格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续流程。源站未提供更详细的使用步骤或代码示例说明。

【质量与限制】

该数据集为 CAMUS 项目数据的处理后版本,源站称其相比原始发布版本更便于初学者使用。数据集仅包含 1 个文件,许可信息为 Unknown。源站未提供数据质量评估、标注精度、覆盖范围或已知偏差等具体说明。

【引用与许可】

使用该数据集时,应引用相关论文:S. Leclerc, E. Smistad, J. Pedrosa, A. Ostvik, et al. “Deep Learning for Segmentation using an Open Large-Scale Dataset in 2D Echocardiography,” IEEE Transactions on Medical Imaging, vol. 38, no. 9, pp. 2198-2210, Sept. 2019, doi: 10.1109/TMI.2019.2900516。许可信息为 Unknown,源站未提供具体的许可条款说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://kaggle.com/datasets/toygarr/camus-dataset

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.12 GB。

数据说明

Toygar Tanyel (2023). CAMUS echocardiographic image segmentation dataset [Dataset]. https://www.kaggle.com/datasets/toygarr/camus-dataset

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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