冠状动脉疾病患者心外膜与皮下脂肪组织表达数据

该数据集来源于 EBI 的 Expression Atlas,收录冠状动脉疾病患者心外膜脂肪组织(EAT)与皮下脂肪组织(SAT)的基因表达数据,物种为 Homo sapiens,实验类型为差异表达分析

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基因组分类Differential
E-GEOD-120774: Expression Data from epicardial (EAT) and subcutaneous adipose tissue (SAT) in patients with coronary artery disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

冠状动脉疾病患者心外膜与皮下脂肪组织表达数据

E-GEOD-120774 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的表达实验数据集,主题为差异表达分析,物种为 Homo sapiens。该数据集提供冠状动脉疾病患者心外膜脂肪组织(EAT)与皮下脂肪组织(SAT)的基因表达数据,用于比较这两类脂肪组织在冠状动脉疾病背景下的表达差异。数据集在本地分类中归入循环系统疾病下的“其他”类别,来源站为 ebi.ac.uk。整体而言,该数据集围绕脂肪组织的转录组差异展开,适合关注冠状动脉疾病与脂肪组织生物学的研究者检索和再利用。

【数据集背景】

冠状动脉疾病是循环系统疾病的重要类型,脂肪组织在其病理过程中受到关注。心外膜脂肪组织与心脏解剖位置邻近,皮下脂肪组织则位于体表,两者在解剖位置和生理环境上存在差异。该数据集以这两类脂肪组织为研究对象,在冠状动脉疾病患者中获取表达数据,并通过差异表达实验设计来呈现组织间的表达差异。数据集的主题标签为 Differential,表明其核心分析类型为差异表达分析,而非单纯的表达谱收录。

【数据内容】

数据集内容为冠状动脉疾病患者心外膜脂肪组织(EAT)与皮下脂肪组织(SAT)的基因表达数据。实验类型为差异表达分析,物种为 Homo sapiens。数据围绕 EAT 与 SAT 两类样本的表达特征组织,用于支持两类脂肪组织之间的表达比较。源站描述未进一步说明样本数量、基因数量、具体差异表达基因列表或统计阈值等细节,这些内容源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,是 Expression Atlas 中的一项实验记录,实验类型标注为 Differential。源站描述明确其物种为 Homo sapiens,并说明数据来自冠状动脉疾病患者的心外膜脂肪组织与皮下脂肪组织。除来源站与实验类型外,关于样本采集地点、采集时间、临床入组标准及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于冠状动脉疾病背景下脂肪组织转录组差异的比较研究,可用于检索 EAT 与 SAT 之间的表达差异,也可作为相关课题的背景数据或验证参考。由于主题标签为 Differential,其典型用途包括差异表达结果的查阅与复现分析。需要说明的是,具体适用分析类型和统计方法应结合源站实验记录判断,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

该数据集通过 EBI Expression Atlas 平台发布,使用者可依据源站实验页面获取表达数据与差异分析结果。使用时应关注实验类型为差异表达分析、物种为 Homo sapiens,以及 EAT 与 SAT 两类组织的对比关系。关于数据下载格式、分析流程、参数设置及可视化方式,源站未提供具体说明,需以源站页面实际提供的内容为准。

【质量与限制】

该数据集为 Expression Atlas 收录的差异表达实验,来源站为 ebi.ac.uk,具备明确的物种与组织信息。其限制在于:源站描述未提供样本量、临床特征、差异表达基因数量及统计显著性阈值等关键细节,因此无法据此评估统计效力或结果稳健性;数据仅涉及 EAT 与 SAT 两类组织,结论外推范围有限。其他质量相关信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 实验记录。关于具体引用文献、作者信息、数据许可条款及使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站页面获取正式的引用与许可说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-120774

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Expression Data from epicardial (EAT) and subcutaneous adipose tissue (SAT) in patients with coronary artery disease

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