巴西非洲裔人群原发性高血压与血压调控基因差异甲基化原始数据及元数据
该数据集包含80份外周血样本的全基因组DNA甲基化数据，样本来自巴西Vale do Ribeira River地区的非洲巴西人群，其中正常血压个体39例、高血压个体41例，使用Infinium Methylation EPIC BeadChip平台检测
基本信息
资源简介
巴西非洲裔人群原发性高血压与血压调控基因差异甲基化原始数据及元数据
Differential methylation in blood pressure control genes is associated to Essential Hypertension in African Brazilian Populations. Raw data (idat files, 850K v1. Illumina) and metadata.
该数据集包含80份外周血样本的全基因组DNA甲基化数据，样本来自巴西Vale do Ribeira River地区的非洲巴西人群，其中正常血压个体39例、高血压个体41例，使用Infinium Methylation EPIC BeadChip平台检测。数据以idat文件（850K v1. Illumina）形式提供，并附元数据。该数据可用于研究DNA甲基化与原发性高血压易感性之间的关联，探索表观遗传机制在高血压遗传缺失中的潜在作用（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
项目资助方：CEPID-FAPESP (Research, Innovation and Dissemination Center), under Grants 1998/14254-2 and 2013/08028-1。源站首次发布：2024-11-24。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：研究描述：遗传学研究已为原发性高血压（EH，定义为血压≥140/90 mmHg）提供线索，但对其遗传力的理解仍存在空白。表观遗传学研究为弥合这些空白提供了有前景的途径。本研究聚焦于Vale do Ribeira River地区的非洲巴西人群，该地区以高血压高发著称。我们通过全基因组分析80份外周血样本（包括正常血压个体39例和高血压个体41例），使用Infinium Methylation EPIC BeadChip平台，探究DNA甲基化是否与高血压易感性相关。数据集描述：该数据集包含来自80份样本（人；Homo sapiens）的全基因组DNA甲基化数据，包括正常血压个体39例和高血压个体41例，样本来源于外周血。血液样本经过处理
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.27891285.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Medical genetics (excl. cancer genetics)。主题标签：DNA Methylation、Essential Hypertension、Quilombo populations、Cardiac Epigenetics、idat、850k methylation array。本站分类：循环系统疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Medical genetics (excl. cancer genetics)。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Differential_methylation_in_blood_pressure_control_genes_is_associated_to_Essential_Hypertension_in_African_Brazilian_Populations_Raw_data_idat_files_850K_v1_Illumina_and_metadata_/27891285
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Martins, Camila; Mingroni-Netto, Regina (2024). Differential methylation in blood pressure control genes is associated to Essential Hypertension in African Brazilian Populations. Raw data (idat files, 850K v1. Illumina) and metadata.. figshare. Dataset
下载信息
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.27891285
标准获取流程：
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- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
研究描述 遗传学研究为原发性高血压（EH）的机制提供了线索，原发性高血压定义为血压升高（≥140/90 mmHg），但对其遗传性的理解仍存在空白。表观遗传学研究为弥合这些空白提供了有前景的途径。本研究聚焦于巴西Vale do Ribeira河流域的非洲裔巴西人群，该地区以高血压高发著称。我们通过对80份外周血样本（包括血压正常者39例和高血压患者41例）进行全基因组分析，采用Infinium Methylation EPIC BeadChip平台，探究DNA甲基化是否与高血压易感性相关。数据集描述 本数据集包含来自80份样本（人类；Homo sapiens）的全基因组DNA甲基化数据，包括血压正常者（39例）和高血压患者（41例），样本来源于外周血。血液样本经标准盐析法提取方案或自动化系统处理以提取DNA，所用系统包括Autopure LS（Gentra Systems）和QIAsymphony DNA Midi Kit（96）（Qiagen，Venlo Limburg，荷兰）。
提取的DNA随后使用EZ DNA甲基化试剂盒（Zymo Research，德国弗赖堡）经亚硫酸氢钠处理，以制备用于下游甲基化分析。杂交使用Infinium MethylationEPIC v1 BeacChip试剂盒（Illumina®，美国加利福尼亚州圣迭戈）进行。处理后的样本随后使用HiScanSQ系统扫描。该元数据记录包含由Infinium DNA甲基化芯片生成的原始idat文件的相关信息。原始idat文件及注释文件可应要求提供。访问条款：DNA甲基化数据集仅可用于旨在增进对表观遗传因素在原发性高血压病因学和生物学中影响的理解的研究。该数据不得用于其他目的，即研究可能导致识别的表观遗传特征
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
