二尖瓣脱垂患者铁死亡相关基因功能分析数据表

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 XLSX 文件,标题为二尖瓣脱垂患者中差异表达铁死亡相关基因的功能分析表

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2023-06-21 更新
浏览 6
基因组分类valve diseasemitral value prolapseferroptosislncRNAgene
Data from: Transthoracic echocardiography in patients undergoing mitral valve repair: comparison of new transthoracic 3D techniques to 2D transoesophageal echocardiography in the localization of mitral valve prolapse

基本信息

模态
基因组
大小
0.000019866 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-21
版本
v1

资源简介

二尖瓣脱垂患者铁死亡相关基因功能分析数据表

Table4_Functional analysis of differently expressed ferroptosis-related genes in patients with mitral valve prolapse.XLSX

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 XLSX 文件,标题为二尖瓣脱垂患者中差异表达铁死亡相关基因的功能分析表。源站描述显示,研究采集二尖瓣脱垂患者与健康志愿者的血液样本进行转录组测序,分析铁死亡相关差异表达基因与差异表达长链非编码 RNA 的共表达网络,并开展 GO 与 KEGG 富集分析,涉及 CDKN2A、SLC1A4、ATF3 等核心基因。该数据可用于探索二尖瓣脱垂中铁死亡相关基因与 lncRNA 的潜在致病机制及治疗靶点研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Mitral Valve Prolapse》发表于 Annual Review of Medicine(2012),DOI:10.1146/annurev-med-022811-091602。源站首次发布:2022-11-29。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:二尖瓣脱垂(MVP)在心脏瓣膜疾病中的患病率在全球范围内不断上升。然而,对其病因和发病机制的理解仍然有限。迄今为止,铁死亡相关基因与长链非编码 RNA(lncRNA)在 MVP 中的关系尚未被探索。本研究探讨铁死亡相关基因在 MVP 中的潜在发病机制,并为该疾病提供治疗靶点。方法:采集 MVP 患者和健康志愿者的血液样本进行转录组测序,以分析铁死亡相关差异表达基因(DEGs)和差异表达长链非编码 RNA(DElncRNAs)的表达,构建铁死亡相关 DEGs 与 DElncRNAs 的共表达网络。此外,本研究进行了 GO 和 KEGG 富集分析。结果:CDKN2A、SLC1A4、ATF3 及其他与 m 相关的核心基因

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 19.87 KB。数据集 DOI:10.3389/fgene.2022.1062212.s004。

【主题与分类】

源站学科分类:Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。主题标签:valve disease、mitral value prolapse、ferroptosis、lncRNA、gene。本站分类:循环系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table4_Functional_analysis_of_differently_expressed_ferroptosis-related_genes_in_patients_with_mitral_valve_prolapse_XLSX/21638930

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Xie, Hui; Wang, Liushun; Tang, Yihu; Zhao, Meng; Wang, Zihao; Liu, Mingzhu; et al. (2022). Table4_Functional analysis of differently expressed ferroptosis-related genes in patients with mitral valve prolapse.XLSX. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-21,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table4_Functional analysis of differently expressed ferroptosis-related genes in patients with mitral valve prolapse.XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/38360129"

文件清单

  • Table4_Functional analysis of differently expressed ferroptosis-related genes in patients with mitral valve prolapse.XLSX(19.87 KB)

文件总体积 19.87 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景:二尖瓣脱垂(MVP)在心脏瓣膜疾病中的患病率在全球范围内呈上升趋势。然而,对其病因和发病机制的认识仍然有限。迄今为止,铁死亡相关基因与长链非编码RNA(lncRNA)在MVP中的关系尚未被探索。本研究探讨铁死亡相关基因在MVP中的潜在发病机制,并为该疾病提供治疗靶点。方法:收集MVP患者和健康志愿者的血液样本进行转录组测序,分析铁死亡相关差异表达基因(DEGs)和差异表达长链非编码RNA(DElncRNAs)的表达,构建铁死亡相关DEGs与DElncRNAs的共表达网络。此外,本研究进行了GO和KEGG富集分析。结果:筛选出CDKN2A、SLC1A4、ATF3等与二尖瓣脱垂相关的核心基因。CDKN2A、SLC1A4和ATF3基因位于网络的核心位置,受众多lncRNAs调控。值得注意的是,这些基因主要参与细胞外区域和p53信号通路。

结论:总之,CDKN2A、SLC1A4和ATF3调控MVP的病理生理过程,是潜在的治疗靶点。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fgene.2022.1062212.s004(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table4_Functional_analysis_of_differently_expressed_ferroptosis-related_genes_in_patients_with_mitral_valve_prolapse_XLSX/21638930)。

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