心脏发生转录图谱与先天性心脏病相互作用组数据
该数据集来自 ebi.ac.uk，为小鼠心脏发生过程的转录组芯片数据，覆盖从胚胎干细胞到成体心脏结构的时间序列全基因组表达谱
基本信息
资源简介
心脏发生转录图谱与先天性心脏病相互作用组数据
Transcriptional Atlas of Cardiogenesis Maps Congenital Heart Disease Interactome
该数据集来自 ebi.ac.uk，为小鼠心脏发生过程的转录组芯片数据，覆盖从胚胎干细胞到成体心脏结构的时间序列全基因组表达谱。数据包含时间与空间表达特征，可用于分析阶段特异性基因功能、构建心脏发生动态转录图谱，并结合先天性心脏病相互作用组解析疾病相关调控网络（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：哺乳动物心脏发育建立在高度保守的分子机制之上，多基因扰动会导致一系列先天性心脏病（CHD）。然而，调控正常心脏发生的转录景观在很大程度上仍基于候选基因方法。在此，我们设计了一项时间序列转录组分析，以研究从小鼠胚胎干细胞到成体心脏结构的先天心脏发生的全基因组表达谱。这项综合分析生成了时间和空间表达谱，优先确定了阶段特异性基因功能，并将心脏发生的动态转录组映射到精选通路。结合先天性心脏病相互作用组的生物信息学，我们解构了该心脏发生图谱中编码的以疾病为中心的调控网络，以揭示阶段
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类：循环系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-51483
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
XING LI; Xing Li; Almudena Martinez-Fernandez; Andre Terzic; Timothy Nelson (2014). Transcriptional Atlas of Cardiogenesis Maps Congenital Heart Disease Interactome [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-51483
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
