猪心脏t-tubule异质性数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.fb300

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.81 GB。

数据说明

背景：T管是肌膜的内陷结构，在哺乳动物心肌细胞的兴奋-收缩耦联中发挥关键作用。尽管通常认为心房肌细胞中基本不存在T管，但近期对大型哺乳动物心房细胞的研究提示，T管可能比先前设想的更为丰富。然而，不同心肌细胞之间T管网络程度的异质性仍不清楚。本研究旨在探讨猪心房肌细胞的T管网络，并与心室组织进行比较。方法：心脏组织取自年轻雌性长白猪（45–75 kg，5–6月龄）。通过含胶原酶的溶液经动脉灌注分离心肌细胞。在负载fluo-4-AM并经电场刺激的分离细胞中检测Ca2+瞬变。使用di-8-ANEPPS显示分离细胞的膜结构。在经Alexa-Fluor 488偶联WGA染色的固定冰冻组织切片中显示T管。通过施加阈值获得二值图像，并计算T管密度（TTD）。

采用距离映射方法计算至最近t小管的半距离（HDTT）。结果与结论：Ca2+瞬变的时空特性似乎与分离心房肌细胞中缺乏功能性t小管相一致。然而，在冷冻切片中，可在一部分心房细胞亚群中识别出t小管。所有心室肌细胞的TTD均>3%（平均TTD = 6.94±0.395%，n = 24），而22个心房细胞中仅有5个符合这一标准。心房平均TTD（2.35±0.457%，n = 22）低于心室TTD（P<0.0001）。TTD与细胞宽度相关（r = 0.7756，n = 46，P<0.0001）。在TTD ≤3%的心房细胞中，HDTT（2.29±0.16 μm，n = 17）显著大于心室细胞（1.33±0.05 μm，n = 24，P<0.0001）或TTD >3%的心房细胞（1.65±0.06 μm，n = 5，P<0.05）。这些数据表明

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。