心脏胶原相关淀粉样蛋白AL59的冷冻电镜结构

该数据集包含通过冷冻电镜技术解析的心脏胶原相关淀粉样蛋白AL59的三维结构数据,其模态为蛋白质分子结构数据,主要应用于研究AL淀粉样变性病中淀粉样蛋白与胶原蛋白相互作用形成的病理超微结构,为理解该心脏疾病的分子机制和开发潜在治疗策略提供结构基础。

Protein Data Bank Japan
2025-07-09 更新
浏览 21
心脏淀粉样变性病蛋白质结构解析
Cryo-EM structure of cardiac collagen-associated amyloid AL59

基本信息

创建/更新时间
2025-07-09

资源简介

心脏胶原相关淀粉样蛋白AL59的冷冻电镜结构

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Cryo-EM structure of cardiac collagen-associated amyloid AL59》。

【数据内容】

源站原始描述:systemic AL amyloid fibril, PROTEIN FIBRIL

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1038/s41467-024-50686-2。

【主题与分类】

主题标签:PROTEIN FIBRIL。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/9FAA

规范引用:Helical superstructures between amyloid and collagen in cardiac fibrils from a patient with AL amyloidosis. (2024) Nat Commun

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了心脏胶原相关淀粉样蛋白AL59的冷冻电镜结构数据,分辨率达到3.6 Å。数据来源于一名AL淀粉样变性病患者的心脏纤维样本,包含单克隆免疫球蛋白轻链(LC)的结构信息以及2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖的分子描述符。该数据集通过电子显微镜方法构建,主要用于研究淀粉样蛋白与胶原蛋白在心脏纤维中形成的螺旋超微结构,对于理解AL淀粉样变性病的病理机制、蛋白质错误折叠以及相关心脏疾病的分子基础具有重要价值。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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