从ATTR T60A淀粉样变性患者1心脏中提取的淀粉样蛋白原纤维冷冻电镜结构
该数据集包含了从一名ATTR T60A淀粉样变性患者心脏组织中提取的淀粉样蛋白原纤维的冷冻电镜结构数据,其数据模态为通过冷冻电子显微镜技术解析的蛋白质三维结构模型,主要应用于研究遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性的病理机制、蛋白质错误折叠与聚集的分子基础,并为针对该疾病的靶向药物设计提供关键的结构生物学依据。
基本信息
资源简介
该数据集是来自一名ATTR T60A遗传性淀粉样变性(ATTRv)患者心脏组织的淀粉样蛋白原纤维的冷冻电子显微镜(cryo-EM)结构数据,分辨率为3.4埃。数据内容为转甲状腺素蛋白(Transthyretin)形成的异常淀粉样纤维的原子级三维结构模型。该数据通过冷冻电镜技术解析,并已存入蛋白质数据库日本(PDB Japan),相关研究揭示了ATTRv-T60A淀粉样纤维在不同患者和器官间的结构和分子同质性。该数据集主要用于研究遗传性淀粉样变性的病理机制、蛋白质错误折叠与聚集过程,并为相关疾病的药物研发提供结构基础。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/9d21
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是来自一名ATTR T60A遗传性淀粉样变性(ATTRv)患者心脏组织的淀粉样蛋白原纤维的冷冻电子显微镜(cryo-EM)结构数据,分辨率为3.4埃。数据内容为转甲状腺素蛋白(Transthyretin)形成的异常淀粉样纤维的原子级三维结构模型。该数据通过冷冻电镜技术解析,并已存入蛋白质数据库日本(PDB Japan),相关研究揭示了ATTRv-T60A淀粉样纤维在不同患者和器官间的结构和分子同质性。该数据集主要用于研究遗传性淀粉样变性的病理机制、蛋白质错误折叠与聚集过程,并为相关疾病的药物研发提供结构基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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