单细胞测序探究免疫细胞群在癌症相关脂肪消耗中的关键作用
该数据集包含胃癌患者皮下脂肪和大网膜脂肪组织中血管间质组分的单细胞转录组测序数据,涵盖伴发恶病质与无恶病质各四例样本,数据模态为单细胞基因表达谱。它主要用于探究免疫细胞群在癌症相关脂肪消耗中的作用机制,支持癌症恶病质、脂肪组织微环境及免疫代谢等方向的研究。

基本信息
资源简介
单细胞测序探究免疫细胞群在癌症相关脂肪消耗中的关键作用
【一句话概览】
该研究从接受手术治疗的胃癌患者皮下脂肪及大网膜脂肪组织中分离血管间质组分,并进行单细胞转录组测序建库,旨在探究免疫细胞群在癌症相关脂肪消耗中的关键作用。研究设置伴发恶病质组与无恶病质组,每组各选择四例(来源 ISC 科学数据,CC0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023-06-27。
【数据内容】
源站原始描述:从进行手术治疗的胃癌患者皮下脂肪及大网膜脂肪组织中分离血管间质组分,并进行单细胞转录组测序建库。伴发恶病质组选择四例,无恶病质组选择四例。
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):从接受手术治疗的胃癌患者中分离皮下脂肪和大网膜脂肪组织的血管间质组分,并进行单细胞转录组测序建库。伴发恶病质组选取4例,无恶病质组选取4例。
【主题与分类】
主题标签:单细胞转录组测序、脂肪组织、免疫细胞、single cell sequencing、Adipose tissues、immune cells、人、脂肪组织、white adipose tissue、转录组。
【获取与许可】
源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=649a6439222f0139804a8d12
使用许可:CC0。
规范引用:35786.11.e23b8570ec0f47a384b9dabf6e11f986
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源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=649a6439222f0139804a8d12
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个医学研究数据集,通过单细胞转录组测序技术,探究胃癌患者中免疫细胞群在癌症相关脂肪消耗(恶病质)中的关键作用。数据集包含来自八例胃癌患者的皮下脂肪和大网膜脂肪组织中血管间质组分的单细胞测序数据,其中四例伴发恶病质,四例无恶病质。数据来源于中国科学院上海营养与健康研究所的干细胞与再生医学数据中心,通过手术样本分离和单细胞测序建库构建。主要研究方向包括癌症恶病质的免疫机制、脂肪组织微环境以及单细胞水平的基因表达分析,适用于癌症生物学、免疫代谢和精准医疗等领域的研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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