cBioPortal癌症基因组数据集
cBioPortal癌症基因组数据集提供多癌种突变、拷贝数、表达、临床注释和研究下载数据，数据模态为表格，可用于癌症相关病例识别、诊断建模、分割检测、风险评估或临床研究复现。
基本信息
资源简介
cBioPortal癌症基因组数据集
【一句话概览】
该数据页面以表格形式列出各癌症研究可用的样本数量及数据类型，并提供各研究数据的下载链接；如需其他下载方式，可参阅下载文档。页面涉及癌症、基因组学、突变、CNA、RNA-Seq 及 cBioPortal 等标签（来源 cbioportal.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Datasets》。
【数据内容】
源站原始描述：The table below lists the number of available samples per cancer study and data type. It also provides links to download the data for each study. For alternative ways of downloading, see the Download Documentation
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：下表列出了每项癌症研究和数据类型可用的样本数量，并提供了下载每项研究数据的链接。有关其他下载方式，请参阅下载文档。
【主题与分类】
主题标签：cancer、genomics、mutations、CNA、RNA-Seq、cBioPortal。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.cbioportal.org/datasets
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.cbioportal.org/datasets
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
cBioPortal Datasets 数据集包含多癌种突变、拷贝数、表达、临床注释和研究下载数据，可围绕癌症（Cancer）开展病例筛选、特征提取、诊断分类、分割检测或预后分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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