携带罕见遗传变异的西班牙Brugada综合征患者特征

该数据集为西班牙Brugada综合征队列中携带SCN5A、SCN2B或RANGRF罕见遗传变异先证者的临床特征表,包含年龄、性别、症状、ICD植入及电生理检查结果等信息,并标注了既往未报道的变异

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2023-06-01 更新
浏览 2
基因组分类RANGRF2bSpanish BrS cohortComprehensive Genetic CharacterizationvariantSCN 5Amlpa
Characteristics of the Spanish BrS patients carrying rare genetic variations.

基本信息

模态
基因组
大小
0.000013824 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

携带罕见遗传变异的西班牙Brugada综合征患者特征

Characteristics of the Spanish BrS patients carrying rare genetic variations.

该数据集为西班牙Brugada综合征队列中携带SCN5A、SCN2B或RANGRF罕见遗传变异先证者的临床特征表,包含年龄、性别、症状、ICD植入及电生理检查结果等信息,并标注了既往未报道的变异。数据可用于分析基因型与临床表型的关联,支持Brugada综合征遗传变异发现率及致病性评估相关研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Comprehensive Genetic Characterization of a Spanish Brugada Syndrome Cohort》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0132888。源站首次发布:2015-07-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该表展示了携带SCN5A、SCN2B或RANGRF罕见遗传变异的先证者的临床特征。除RANGRF中所发现的变异意义未知外(见讨论),其余均为潜在致病性变异。所有既往报道的潜在致病性变异(PPVs),除p.P1725L和p.R1898C外,均已在BrS患者中鉴定到。p.P1725L与长QT综合征相关,p.R1898C在Exome Variant Server中发现,MAF为0.0079%。在对照人群中未鉴定到罕见变异。患者年龄以年表示。粗体标识携带既往未描述变异的患者。M,男性;F,女性;S,晕厥;ICD,心内植入式心律转复除颤器;UK,未知;EPS,电生理检查(+,阳性反应;-,阴性反应;N/P,未进行)。The tw

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 13.82 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0132888.t002。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:RANGRF、2b、Spanish BrS cohort、Comprehensive Genetic Characterization、variant、SCN 5A、mlpa。本站分类:心血管系统疾病/Brugada综合征。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characteristics_of_the_Spanish_BrS_patients_carrying_rare_genetic_variations_/1482357

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Selga, Elisabet; Campuzano, Oscar; Pinsach-Abuin, Mel·lina; Pérez-Serra, Alexandra; Mademont-Soler, Irene; Riuró, Helena; et al. (2015). Characteristics of the Spanish BrS patients carrying rare genetic variations.. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Table_2.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/2174585"

文件清单

  • Table_2.xls(13.82 KB)

文件总体积 13.82 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

该表展示了携带SCN5A、SCN2B或RANGRF罕见基因变异的先证者的临床特征。除RANGRF中发现的变异意义未知外(见讨论),其余均为潜在致病性变异。所有先前报道的潜在致病性变异(PPVs),除p.P1725L和p.R1898C外,均已在BrS患者中被识别。p.P1725L与长QT综合征相关,而p.R1898C在Exome Variant Server中发现,其最小等位基因频率(MAF)为0.0079%。对照组人群中未发现罕见变异。患者年龄以年表示。加粗标识表示携带先前未描述变异的患者。M,男性;F,女性;S,晕厥;ICD,植入式心律转复除颤器;UK,未知;EPS,电生理检查(+,阳性反应;-,阴性反应;N/P,未进行)。分别携带两个PPVs的两名患者分别由a和b标识。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0132888.t002(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characteristics_of_the_Spanish_BrS_patients_carrying_rare_genetic_variations_/1482357)。

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