房颤相关左心房重构中的循环蛋白质组模式提示凝血与补体级联参与

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLOS ONE(2018),包含 3 个补充文件,围绕房颤相关左心房电解剖重构与直径增大展开

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2023-06-04 更新
浏览 7
蛋白质分类Untargeted proteome analysiscoagulationuntargeted proteomics approachAF catheter ablationplasma protein candidatesMethods Peripheral blood samplespilot proteomic studyCirculating proteomic patternsLApathwayLC-ESI-Tandem mass spectrometryLVA
Circulating proteomic patterns in AF related left atrial remodeling indicate involvement of coagulation and complement cascade

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000791552 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

房颤相关左心房重构中的循环蛋白质组模式提示凝血与补体级联参与

Circulating proteomic patterns in AF related left atrial remodeling indicate involvement of coagulation and complement cascade

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLOS ONE(2018),包含 3 个补充文件,围绕房颤相关左心房电解剖重构与直径增大展开。研究采集 48 例接受房颤导管消融患者术前外周血,采用非靶向蛋白质组学(LC-ESI 串联质谱、非标记强度工作流)分析,识别与左心房低电压区相关的差异丰度蛋白,涉及凝血与补体级联通路。数据可用于探索房颤进展、高凝状态及治疗反应相关的循环蛋白候选标志物(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Circulating proteomic patterns in AF related left atrial remodeling indicate involvement of coagulation and complement cascade》发表于 PLOS ONE(2018),DOI:10.1371/journal.pone.0198461。源站首次发布:2018-11-29。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 心房颤动(AF)中的左心房(LA)电解剖重构和直径增大提示疾病进展,并与治疗成功率低相关。此外,AF 导致高凝状态,而高凝状态反过来在实验环境中促进 AF 基质的发展和疾病进展。本研究的目的是使用非靶向蛋白质组学方法识别与 AF 患者 LA 重构相关的通路。方法 收集 48 例接受 AF 导管消融患者(62±10 岁,63% 男性,59% 持续性 AF)消融前的外周血样本。23 例具有左心房低电压区(LVA)的患者,定义为 2DS2-VASc 评分。使用 LC-ESI 串联质谱以非标记强度工作流进行非靶向蛋白质组分析。识别出显著差异丰度蛋白

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 791.55 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0198461。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签:Untargeted proteome analysis、coagulation、untargeted proteomics approach、AF catheter ablation、plasma protein candidates、Methods Peripheral blood samples、pilot proteomic study、Circulating proteomic patterns、LA、pathway。本站分类:心血管系统疾病/心房扑动。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Circulating_proteomic_patterns_in_AF_related_left_atrial_remodeling_indicate_involvement_of_coagulation_and_complement_cascade/7401011

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Kornej, Jelena; Büttner, Petra; Hammer, Elke; Engelmann, Beatrice; Dinov, Borislav; Sommer, Philipp; et al. (2018). Circulating proteomic patterns in AF related left atrial remodeling indicate involvement of coagulation and complement cascade. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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文件清单

  • pone.0198461.s001.doc(474.11 KB)
  • pone.0198461.s002.doc(68.10 KB)
  • pone.0198461.s003.doc(249.34 KB)

文件总体积 791.55 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
心房颤动(AF)中左心房(LA)电解剖重构和直径增大提示疾病进展,并与治疗成功率低相关。此外,AF导致高凝状态,而高凝状态反过来又在实验环境中促进AF基质的发展和疾病进展。本研究旨在使用非靶向蛋白质组学方法识别与AF患者LA重构相关的通路。方法
收集48例接受AF导管消融的患者(62±10岁,63%为男性,59%为持续性AF)消融前的外周血样本。23例患者存在左心房低电压区(LVA),定义为2DS2-VASc评分。采用LC-ESI串联质谱在非标记强度工作流程中进行非靶向蛋白质组分析。鉴定显著差异丰度蛋白,并将其用于通路分析和蛋白-蛋白相互作用分析。结果
分析覆盖了280种非冗余循环血浆蛋白。

左心耳(LVA)的存在与30种凝血和补体级联反应差异丰富蛋白相关(q值<0.05)。结论:这项初步蛋白质组学研究识别出与心房颤动(AF)电解剖重构相关的血浆蛋白候选物,并指向凝血和补体途径、组织重构及炎症的失衡。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0198461(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Circulating_proteomic_patterns_in_AF_related_left_atrial_remodeling_indicate_involvement_of_coagulation_and_complement_cascade/7401011)。

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