TGFB1功能性多态性rs1800469与两个中国汉族人群心房颤动易感性

该数据集来自 plos.figshare.com,围绕 TGFB1 基因启动子区常见多态性 rs1800469 与中国汉族人群心房颤动(AF)易感性的关联研究,包含两个医院来源的独立病例对照人群:中国东南人群(581 例 AF 患者与 723 例对照)和中国东北人群(308 例 AF 患者与 292

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2023-06-09 更新
浏览 9
基因组分类polymorphismrs1800469susceptibilityatrialfibrillationchinesehanpopulations
TheTGFB1 Functional Polymorphism rs1800469 and Susceptibility to Atrial Fibrillation in Two Chinese Han Populations

基本信息

模态
基因组
大小
0.00009728 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-09
版本
v1

资源简介

TGFB1功能性多态性rs1800469与两个中国汉族人群心房颤动易感性

TheTGFB1 Functional Polymorphism rs1800469 and Susceptibility to Atrial Fibrillation in Two Chinese Han Populations

该数据集来自 plos.figshare.com,围绕 TGFB1 基因启动子区常见多态性 rs1800469 与中国汉族人群心房颤动(AF)易感性的关联研究,包含两个医院来源的独立病例对照人群:中国东南人群(581 例 AF 患者与 723 例对照)和中国东北人群(308 例 AF 患者与 292 例对照),其中 278 例为孤立性 AF、334 例为阵发性 AF。数据文件为 Table_S1.doc 与 Table_S2.doc,可用于分析该位点基因型与等位基因频率、左心房内径等指标与 AF 风险的关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《The TGFB1 Functional Polymorphism rs1800469 and Susceptibility to Atrial Fibrillation in Two Chinese Han Populations》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0083033。源站首次发布:2013-12-12。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):转化生长因子-β1(TGF-β1)与心房纤维化程度相关,并在心房颤动(AF)的诱发和维持中起关键作用。为研究 TGF-β1 基因(TGFB1)中常见启动子多态性 rs1800469 与中国汉族人群 AF 风险的关联,我们开展了两个医院来源的独立人群的病例对照研究:中国东南人群(581 例 AF 患者和 723 例对照)和中国东北人群(308 例 AF 患者和 292 例对照)。278 例 AF 为孤立性 AF,334 例 AF 被诊断为阵发性 AF。在两个人群中,AF 患者的左心房内径均大于对照。TGFB1 基因中 rs1800469 的基因型通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性测定。基因型和等位基因频率

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 97.28 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0083033。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:polymorphism、rs1800469、susceptibility、atrial、fibrillation、chinese、han、populations。本站分类:心血管系统疾病/心房颤动。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_TGFB1_Functional_Polymorphism_rs1800469_and_Susceptibility_to_Atrial_Fibrillation_in_Two_Chinese_Han_Populations/876115

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zheng, Weixing; Yan, Chenghui; Wang, Xiaohu; Luo, Zhurong; Chen, Fengping; Yang, Yuhui; et al. (2016). TheTGFB1 Functional Polymorphism rs1800469 and Susceptibility to Atrial Fibrillation in Two Chinese Han Populations. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-09,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/1312891"
curl -L -o "Table_S2.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/1312892"

文件清单

  • Table_S1.doc(51.20 KB)
  • Table_S2.doc(46.08 KB)

文件总体积 97.28 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

转化生长因子-β1(TGF-β1)与心房纤维化程度相关,并在心房颤动(AF)的发生和维持中起关键作用。为了研究TGF-β1基因(TGFB1)中常见的启动子多态性rs1800469与中国汉族人群AF风险的关系,我们对两个基于医院的独立人群进行了病例对照研究:中国东南部人群(581例AF患者和723例对照),以及中国东北部人群(308例AF患者和292例对照)。278例AF为孤立性AF,334例AF被诊断为阵发性AF。在两个人群中,AF患者的左心房直径均大于对照组。TGFB1基因中rs1800469的基因型通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性确定。在中国东南部人群、中国东北部人群以及总研究人群中,AF患者与对照组之间rs1800469的基因型和等位基因频率均无差异。

在调整年龄、性别、高血压和左房内径后,rs1800469多态性与房颤风险在显性、隐性和加性遗传模型下均无关联。对孤立性及阵发性房颤亚组的分析也得到了相似结果。我们的结果不支持TGFB1 rs1800469功能性基因变异在中国汉族人群房颤发生中的作用。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0083033(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_TGFB1_Functional_Polymorphism_rs1800469_and_Susceptibility_to_Atrial_Fibrillation_in_Two_Chinese_Han_Populations/876115)。

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