全基因组关联分析结果:严格定义的心房颤动与全部对照
该数据集为一项全基因组关联研究的汇总水平结果,比较严格定义的心房颤动与全部对照,来源于 zenodo.org,由 Sara L Pulit 于 2017 年发布

基本信息
资源简介
全基因组关联分析结果:严格定义的心房颤动与全部对照
Genome-wide association results: strictly-defined atrial fibrillation vs. all controls
该数据集为一项全基因组关联研究的汇总水平结果,比较严格定义的心房颤动与全部对照,来源于 zenodo.org,由 Sara L Pulit 于 2017 年发布。数据包含 SNP 标识、染色体与碱基位置(hg19)、等位基因、等位基因频率、缺失率,以及基于 BOLT-LMM 线性混合模型得到的效应量、标准误和 p 值等字段。该数据可用于心房颤动的遗传关联分析、候选位点评估及相关方法学研究(来源 Zenodo,cc-by-4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2017-10-24。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):来自一项广泛定义的心房颤动与对照比较分析的全基因组关联研究汇总水平结果。各列如下:SNP:rs 标识符 CHR:染色体,build hg19 BP:碱基对位置,build hg19 GENPOS:遗传位置 ALLELE1:被检验(第一)等位基因 ALLELE0:另一等位基因 A1FREQ:ALLELE1 的频率 F_MISS:该 SNP 的缺失率 BETA:来自 BOLT-LMM 中线性混合模型的 beta(效应量) SE:来自 BOLT-LMM 中线性混合模型的标准误 P_BOLT_LMM_INF:来自 BOLT-LMM 中线性混合模型(无穷小模型)的 p 值
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 296.41 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.1035873。
【主题与分类】
主题标签:心血管系统疾病、心房颤动、全基因组关联分析、GWAS汇总统计、BOLT-LMM、SNP。本站分类:心血管系统疾病/心房颤动。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/1035873
使用许可:cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2020-01-21,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
curl -L -o "stroke.all.consensus.AFR.EUR.QC2.imputed.boltlmm.afib.strict.allcontrols.nonGRM.results.pcs.txt.gz" "https://zenodo.org/api/records/1035873/files/stroke.all.consensus.AFR.EUR.QC2.imputed.boltlmm.afib.strict.allcontrols.nonGRM.results.pcs.txt.gz/content"
文件清单
stroke.all.consensus.AFR.EUR.QC2.imputed.boltlmm.afib.strict.allcontrols.nonGRM.results.pcs.txt.gz(282.7 MB)
数据集大小约 296.4 MB。
数据说明
对广泛定义的心房颤动与对照进行分析所得的全基因组关联研究汇总级结果。各列如下:SNP:rs标识符 CHR:染色体,构建版本hg19 BP:碱基对位置,构建版本hg19 GENPOS:遗传位置 ALLELE1:被检验(第一)等位基因 ALLELE0:另一等位基因 A1FREQ:ALLELE1的频率 F_MISS:该SNP的缺失率 BETA:BOLT-LMM中线性混合模型的beta(效应量) SE:BOLT-LMM中线性混合模型的标准误 P_BOLT_LMM_INF:BOLT-LMM中线性混合模型(无穷小模型)的p值
许可
cc-by-4.0
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