动脉粥样硬化蛋白质组学——Bialystok Plus 队列研究

这里使用的数据集是 Bialystok PLUS 队列研究的一部分,该研究从市政办公室数据库中随机选取 Białystok 居民并邀请其参与研究

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蛋白质预测心血管系统疾病动脉粥样硬化蛋白质组学队列研究风险因素
Proteomic for atherosclerosis - Bialystok Plus Cohort Studies

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.067281535 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

动脉粥样硬化蛋白质组学——Bialystok Plus 队列研究

Proteomic for atherosclerosis - Bialystok Plus Cohort Studies 是一个与心血管系统疾病中动脉粥样硬化相关的蛋白质组学数据集,归属于 Bialystok PLUS 队列研究体系。该数据集汇集了蛋白质组学信息与动脉粥样硬化风险因素相关数据,来源于 doi.org,由 Szpakowicz, Anna、Lesiński, Wojciech、Tuchliński, Jakub Karol、Roszkowska, Urszula、Dubatówka, Marlena、Stachurska, Zofia、Kondraciuk, Marcin、Rudnicki, Witold R. 与 Kamiński, Karol Adam 共同完成,存放于 Zenodo,发布时间为 2026 年,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。该数据集面向动脉粥样硬化研究中的蛋白质组学分析需求,配套提供了用于分析数据的 R 代码文件与结果文件,便于研究者了解数据处理与结果呈现的完整过程。

【数据集背景】

该数据集是 Bialystok PLUS 队列研究的一部分。Bialystok PLUS 队列研究从市政办公室数据库中随机选取 Białystok 居民,并邀请其参与研究。这一抽样与招募方式构成了该数据集所依托的人群基础。数据集所属分类为心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化,说明其研究关注点集中在动脉粥样硬化这一心血管系统疾病领域。数据集的建立与发布,旨在为动脉粥样硬化相关的蛋白质组学研究提供可用的数据资源,并配合分析代码与结果文件,支持研究过程的透明化与可重复性。

【数据内容】

数据集包含蛋白质组学数据与动脉粥样硬化风险因素数据。源站描述明确指出,数据中包含 proteomics 与 atherosclerosis risk factors 两类信息。此外,数据集还附带两个文件:名为“Atherosclerosis.Rmd”的文件包含用于为出版目的分析数据的 R 代码;名为“Atherosclerosis.html”的文件是 R knit 文件,包含分析结果。由此可知,数据集不仅提供原始或整理后的数据内容,还提供了分析脚本与结果呈现文件,形成数据、代码与结果相互配套的结构。关于蛋白质组学数据的具体指标、风险因素的具体条目、样本量、变量数量等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 doi.org,存放机构为 Zenodo。其人群来源为 Bialystok PLUS 队列研究,该研究从市政办公室数据库中随机选取 Białystok 居民并邀请其参与。数据集的作者包括 Szpakowicz, Anna、Lesiński, Wojciech、Tuchliński, Jakub Karol、Roszkowska, Urszula、Dubatówka, Marlena、Stachurska, Zofia、Kondraciuk, Marcin、Rudnicki, Witold R. 与 Kamiński, Karol Adam。发布时间为 2026 年。关于样本采集的具体流程、时间跨度、检测平台与方法学细节,源站未提供。

【适用场景】

基于数据集所含的蛋白质组学数据与动脉粥样硬化风险因素数据,该数据集适用于动脉粥样硬化相关的蛋白质组学分析研究,可用于探索蛋白质组学信息与动脉粥样硬化风险因素之间的关联。配套的 R 代码文件与 R knit 结果文件,使其也适用于分析流程复现、方法学参考以及结果核对等场景。数据集所属分类为心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化,因此其适用领域集中在心血管系统疾病研究,尤其是动脉粥样硬化方向。关于具体的适用模型、分析类型或临床决策用途,源站未提供。

【使用方法】

数据集提供了“Atherosclerosis.Rmd”文件,其中包含用于为出版目的分析数据的 R 代码;“Atherosclerosis.html”文件为 R knit 文件,包含分析结果。使用者可借助 R 代码文件了解数据处理与分析的具体步骤,并通过 R knit 结果文件查看相应分析结果。关于数据文件的具体格式、字段说明、运行环境要求及依赖包信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 Bialystok PLUS 队列研究的一部分,其人群来源于从市政办公室数据库随机选取并受邀参与的 Białystok 居民。关于数据的完整性、缺失情况、质量控制指标、样本代表性评估及潜在偏倚等信息,源站未提供。使用者在利用该数据集开展研究时,应结合源站描述与配套代码文件自行评估数据的适用性。

【引用与许可】

该数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,使用时需遵循该许可的署名要求。数据集的作者为 Szpakowicz, Anna、Lesiński, Wojciech、Tuchliński, Jakub Karol、Roszkowska, Urszula、Dubatówka, Marlena、Stachurska, Zofia、Kondraciuk, Marcin、Rudnicki, Witold R. 与 Kamiński, Karol Adam,存放机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。关于具体的引用格式与署名方式,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21769047

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 67.3 MB。

数据说明

此处使用的数据集是Bialystok PLUS队列研究的一部分,该研究中,比亚韦斯托克市的居民是从市政办公室数据库中随机选取并受邀参与研究的。数据包含蛋白质组学和动脉粥样硬化危险因素。文件“Atherosclerosis.Rmd”包含用于分析数据以供发表之用的R代码;文件“Atherosclerosis.html”是一个包含结果的R knit文件。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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