ApoE-/-小鼠主动脉HD+TAR给药后的scRNA-seq
该数据集为ApoE-/-小鼠主动脉在HD+TAR给药条件下的单细胞RNA测序数据，属于心血管系统疾病/动脉粥样硬化方向，主题标签为Raw sequence reads
基本信息
资源简介
ApoE-/-小鼠主动脉HD+TAR给药后的scRNA-seq
PRJNA1527000 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库中的生物项目，全称为“The scRNA-seq of ApoE-/- mice aorta with HD+TAR administration”。该项目围绕 ApoE 基因敲除（ApoE-/-）小鼠的主动脉组织展开，在 HD+TAR 给药条件下进行单细胞 RNA 测序（scRNA-seq），用于获取该实验条件下主动脉细胞的转录组信息。从疾病分类角度看，该数据集归属于心血管系统疾病中的动脉粥样硬化方向，主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读长数据。ApoE-/- 小鼠是动脉粥样硬化研究中常用的模型动物，结合单细胞转录组测序，可在单个细胞层面观察主动脉组织中不同细胞类型的基因表达特征，为理解给药干预下的血管病理变化提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，源站标题为“ID 1527000 - BioProject - NCBI”。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的各类生物学数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录本身为用户提供一个统一的入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集对应的研究计划聚焦于 ApoE-/- 小鼠主动脉在 HD+TAR 给药条件下的单细胞 RNA 测序，属于心血管系统疾病与动脉粥样硬化研究方向。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其数据内容以原始序列读长为主。研究采用单细胞 RNA 测序技术，测序对象为 ApoE-/- 小鼠的主动脉组织，实验条件为 HD+TAR 给药。单细胞 RNA 测序能够在单个细胞分辨率上获取转录组信息，因此该数据可用于分析主动脉组织中各细胞群体的基因表达情况。关于测序的具体细胞数量、测序深度、读长长度、样本数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 BioProject ID 1527000。项目英文名称明确指出了物种与组织来源，即 ApoE-/- 小鼠的主动脉，以及实验处理条件 HD+TAR 给药。关于样本采集的具体时间、地点、操作流程、伦理审批信息以及建库测序平台等，源站未提供。
【适用场景】
基于该数据集的主题标签与研究对象，其潜在适用场景包括：在单细胞水平上研究 ApoE-/- 小鼠主动脉在 HD+TAR 给药条件下的细胞组成与基因表达变化；作为动脉粥样硬化相关研究的参考数据；用于探索不同细胞类型在给药干预下的转录组响应。由于数据内容为原始序列读长，适合具备单细胞测序数据分析能力的用户进行二次分析。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否与某篇论文关联，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 数据库检索 ID 1527000 或项目英文名称进行访问。BioProject 记录汇集了与该项目相关的多种数据类型链接，用户可据此定位原始序列读长数据。关于数据的具体下载方式、文件格式、分析流程建议以及配套的参考基因组信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，说明提供的是原始测序读长，通常需要经过质控、比对、定量等分析步骤后才能用于生物学解释。关于数据质量指标（如 Q30 比例、比对率、细胞过滤标准等）、批次效应、样本重复情况以及潜在的技术偏差，源站未提供。用户在使用时应自行评估数据质量并遵循相应的分析规范。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，记录 ID 为 1527000。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及是否允许再分发等具体条款，源站未提供。用户在使用前应查阅 NCBI 及 BioProject 的相关政策与该项目记录中的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1527000
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在以单细胞分辨率表征慢性香烟焦油暴露在动脉粥样硬化动脉中诱导的细胞和转录改变。ApoE KO小鼠通过腹腔注射接受香烟焦油治疗，每日一次，持续16周。治疗期结束时，从香烟焦油处理组和对照组小鼠中收集主动脉组织，并使用10x Genomics平台进行单细胞RNA测序。该数据集旨在表征慢性香烟焦油暴露后主动脉中细胞类型特异性的转录反应和细胞景观的改变，为香烟焦油诱导的动脉粥样硬化进展的细胞和分子机制提供见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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