ApoE-/-小鼠主动脉HD给药后的scRNA-seq
该数据集为ApoE-/-小鼠主动脉在HD给药条件下的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，属于心血管系统疾病/动脉粥样硬化方向，主题标签为Raw sequence reads
基本信息
资源简介
ApoE-/-小鼠主动脉HD给药后的scRNA-seq
该数据集英文名称为“PRJNA1526998: The scRNA-seq of ApoE-/- mice aorta with HD administration”，来源于NCBI BioProject数据库，源站标题为“ID 1526998 - BioProject - NCBI”。从名称可以看出，该数据集围绕ApoE-/-小鼠主动脉组织，在HD给药条件下开展单细胞RNA测序（scRNA-seq），属于心血管系统疾病中的动脉粥样硬化研究方向，主题标签为“Raw sequence reads”。BioProject作为生物数据的集合记录，旨在将同一项目产生的多种数据类型链接于一处，便于用户集中查找和获取。该数据集为研究动脉粥样硬化相关细胞异质性及HD干预效应提供了原始测序数据基础，适合从事心血管疾病、单细胞组学及药物干预机制研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
动脉粥样硬化是心血管系统疾病中的常见病理过程，涉及血管壁多种细胞类型的复杂相互作用。ApoE-/-小鼠是研究动脉粥样硬化常用的动物模型，因其脂质代谢异常而易于形成动脉粥样硬化病变。HD给药作为一种实验干预条件，可能用于观察该药物对主动脉组织细胞组成和基因表达的影响。该数据集正是在这一研究背景下产生，通过单细胞RNA测序技术，在单细胞水平上捕获ApoE-/-小鼠主动脉在HD给药后的转录组信息。源站未提供更详细的研究背景、具体科学假设或实验目的。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其核心内容为原始测序读段。数据来源于ApoE-/-小鼠主动脉组织，在HD给药条件下进行单细胞RNA测序。单细胞RNA测序能够解析组织内不同细胞类型的转录特征，因此该数据集可能包含主动脉中多种细胞群体的原始序列信息。源站未提供样本数量、测序平台、读长、细胞数、基因数等具体指标，也未说明数据是否包含处理后矩阵或仅包含原始读段。除主题标签外，源站未提供其他数据内容细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，属于NCBI BioProject数据库中的一条记录，源站标题为“ID 1526998 - BioProject - NCBI”。BioProject记录通常汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可能来自单一组织或联盟。该数据集的具体采集地点、实验时间、操作人员、样本处理流程、测序服务提供商等信息，源站未提供。数据以BioProject形式组织，用户可通过该记录查找与之关联的多种数据类型。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病、特别是动脉粥样硬化方向的研究。由于其为单细胞RNA测序的原始序列读段，可用于探索ApoE-/-小鼠主动脉在HD给药条件下的细胞类型组成、细胞状态变化及基因表达差异。适用场景包括但不限于：单细胞转录组数据分析、细胞聚类与注释、差异表达分析、细胞通讯分析以及药物干预效应的初步探索。此外，该数据集也可作为方法学研究的测试数据，或用于与其他动脉粥样硬化相关单细胞数据集进行比较分析。源站未提供具体的适用场景说明，以上为基于数据类型的通用用途描述。
【使用方法】
该数据集以BioProject记录形式提供，用户可通过NCBI网站访问源站标题对应的页面，查找并下载关联的原始序列读段。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用前通常需要进行质量控制、比对、定量和下游分析等标准单细胞RNA测序数据处理步骤。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程及推荐工具，源站未提供。用户应根据自身研究目的和所用分析平台，参考单细胞RNA测序的通用分析规范进行处理。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括测序深度、细胞存活率、数据完整性、批次效应等指标。由于主题标签为“Raw sequence reads”，数据可能未经充分处理，使用前需自行进行质量控制和过滤。此外，该数据集仅针对ApoE-/-小鼠主动脉在HD给药条件下的样本，缺乏对照组或其他条件的直接比较信息，源站未说明是否包含对照样本。因此，在解释结果时需注意实验条件的局限性，避免过度推断。源站未提供其他质量与限制相关说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款。用户在使用该数据集时，应遵循NCBI BioProject数据库的通用使用政策，并建议在相关出版物中引用该BioProject记录。由于源站未提供具体引用格式和许可信息，用户需自行查阅NCBI网站上的相关说明，或联系数据提交者获取进一步授权信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1526998
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在以单细胞分辨率表征慢性香烟焦油暴露在动脉粥样硬化动脉中诱导的细胞和转录改变。ApoE KO小鼠通过腹腔注射接受香烟焦油治疗，每日一次，持续16周。治疗期结束时，从香烟焦油处理组和对照组小鼠中收集主动脉组织，并使用10x Genomics平台进行单细胞RNA测序。该数据集旨在表征慢性香烟焦油暴露后主动脉细胞类型特异性转录反应及细胞景观改变，为香烟焦油诱导动脉粥样硬化进展的细胞和分子机制提供见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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