PRJNA1304779：Homo sapiens 原始序列读段
该数据集来自 NCBI，收录 Homo sapiens 原始序列读段，属于心血管系统疾病中的动脉粥样硬化方向。数据为原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs）在 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与对照（sh-NC）条件下的转录组图谱，用于研究 Ninjurin-1 在动脉粥样硬化形成过程中内皮炎症的作
基本信息
资源简介
PRJNA1304779：Homo sapiens 原始序列读段
PRJNA1304779 收录的是 Homo sapiens 原始序列读段，来源为 NCBI。该数据集聚焦心血管系统疾病中的动脉粥样硬化方向，核心材料是原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs），通过 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与对照（sh-NC）两种条件获得转录组图谱，用以研究 Ninjurin-1 在动脉粥样硬化形成过程中对内皮炎症的作用。相关分析将 Ninj1 识别为 NF-kB/CXCL-8 通路的新型激活因子，推动 ox-LDL 诱导的内皮功能障碍以及 ApoE-/- 小鼠中的斑块进展。整体而言，该数据集为探索内皮炎症与动脉粥样硬化机制提供了原始测序读段层面的资源。
【数据集背景】
动脉粥样硬化是心血管系统疾病的重要类型，内皮炎症在其发生发展中具有关键地位。该数据集围绕 Ninjurin-1（Ninj1）在内皮炎症中的作用展开，研究对象为原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs）。通过将 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与阴性对照（sh-NC）进行比较，旨在揭示 Ninj1 在动脉粥样硬化形成过程中对内皮炎症的调控作用。源站描述指出，分析结果将 Ninj1 识别为 NF-kB/CXCL-8 通路的新型激活因子，并驱动 ox-LDL 诱导的内皮功能障碍以及 ApoE-/- 小鼠中的斑块进展。这一背景使该数据集与心血管系统疾病/动脉粥样硬化方向直接相关。
【数据内容】
该数据集包含 Homo sapiens 的原始序列读段，主题标签为 Raw sequence reads。数据内容为原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs）在 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与 scramble 对照（sh-NC）条件下的转录组图谱。换言之，数据覆盖两种实验条件，用于比较 Ninj1 敲低与对照之间的转录组差异。源站描述还提及，基于这些数据的研究识别出 Ninj1 是 NF-kB/CXCL-8 通路的新型激活因子，并推动 ox-LDL 诱导的内皮功能障碍和 ApoE-/- 小鼠中的斑块进展。除上述内容外，源站未提供更细的样本数量、测序平台、读长或文件类型等信息。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为 PRJNA1304779: Homo sapiens Raw sequence reads。生物材料为原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs），实验条件包括 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与 scramble 对照（sh-NC）。数据以原始序列读段形式收录，属于 Homo sapiens。关于具体的采集时间、地点、伦理审批信息以及建库与测序细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病中动脉粥样硬化方向的研究，尤其是围绕内皮炎症机制的分析。具体而言，可用于比较 HUVECs 在 Ninj1 敲低与对照条件下的转录组图谱，从而探讨 Ninj1 与 NF-kB/CXCL-8 通路之间的关系，以及其在 ox-LDL 诱导的内皮功能障碍和 ApoE-/- 小鼠斑块进展中的潜在作用。由于数据形式为原始序列读段，适合具备转录组数据处理能力的用户进行再分析。其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为原始序列读段，使用前通常需要进行读段质控、比对或定量等转录组标准处理流程，再在 sh-Ninj1 与 sh-NC 两组之间开展差异分析。由于数据来自 HUVECs 的两种条件，分析设计上可围绕 Ninj1 敲低效应展开，并结合源站描述中提到的 NF-kB/CXCL-8 通路、ox-LDL 诱导的内皮功能障碍以及 ApoE-/- 小鼠斑块进展等方向进行解读。关于具体的分析流程、参数与推荐工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI 收录的 Homo sapiens 原始序列读段，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Raw sequence reads。其材料为原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs），条件为 Ninj1 敲低（sh-Ninj1）与对照（sh-NC）。关于数据质量指标、覆盖度、重复数、批次信息以及可能存在的技术偏差，源站未提供。此外，该数据集基于细胞模型，源站描述中虽提及 ApoE-/- 小鼠中的斑块进展，但数据本身为 HUVECs 转录组图谱，相关体内结论的适用范围需结合源站描述理解。其他限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA1304779: Homo sapiens Raw sequence reads。关于具体的引用方式、作者列表、发表文献以及许可条款，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1304779
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含原代人脐静脉内皮细胞（HUVECs）的转录组图谱，涉及Ninj1敲低（sh-Ninj1）与对照 scramble（sh-NC）的比较，旨在研究Ninjurin-1在动脉粥样硬化形成过程中内皮炎症的作用。分析发现，Ninj1是NF-kB/CXCL-8通路的新型激活因子，促进ox-LDL诱导的内皮功能障碍及ApoE-/-小鼠斑块进展。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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