猪瓣膜间质细胞成骨诱导下间质-内皮转化的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308127

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）是一种以纤维化、钙化和内皮功能障碍为特征的进行性疾病。瓣膜间质细胞（VICs）是主动脉瓣内主要的细胞类型，在瓣膜重塑中发挥关键作用。近期证据表明，VICs具有表型可塑性，并可能在钙化条件下发生间充质-内皮转化（MEndT）。为探索这一过程的转录图谱，我们对在生长培养基（GM）中培养的原代猪VICs、在成骨培养基（OM）中培养8天的原代猪VICs以及原代猪瓣膜内皮细胞（pVECs）进行了RNA测序。该数据集为了解MEndT的分子机制及其对CAVD发病机制的潜在贡献提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。