BFGF相关转录调控在成骨培养基诱导瓣膜间质细胞钙化模型中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE225698

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：探讨碱性成纤维细胞生长因子（BFGF）在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的作用及其潜在机制。方法：从猪主动脉瓣叶中分离瓣膜间质细胞。为研究BFGF对VICs成骨分化的影响，加入成骨诱导培养基（OIM）和BFGF。采用RNA测序鉴定基因表达谱的变化。结果：本分析完成了9个样本的全转录组测序，共获得2个差异表达基因组。检测到的差异表达基因数量分别为2526、159。鉴定出6596个lncRNA，检测到的差异表达lncRNA数量分别为349、100。预测出6179个新的circRNA，检测到的差异表达circRNA数量分别为4、243。结论：本研究首次完成了BFGF作用下瓣膜间质细胞全转录组表达的测序，并证明BFGF可抑制瓣膜间质细胞的钙化过程，我们的研究表明bFGF在CAVD的预防和治疗中具有重要价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。