GSE190778:Mediator 通过不依赖 Tail 的机制促进大多数启动子的转录起始

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Mediator 通过不依赖 Tail 的机制促进大多数启动子的转录起始,属于 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成

geo
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基因组GPL173424932
GSE190778: Mediator facilitates transcription initiation at most promoters via a Tail-independent mechanism

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

GSE190778:Mediator 通过不依赖 Tail 的机制促进大多数启动子的转录起始

GSE190778 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries 数据集,标题为“Mediator facilitates transcription initiation at most promoters via a Tail-independent mechanism”,即 Mediator 通过不依赖 Tail 的机制促进大多数启动子的转录起始。该数据集由若干 SubSeries 组成,本站将其归类于心血管系统疾病 / 主动脉瓣疾病方向,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE190778_series_matrix.txt.gz,作者为 Rafal、Donczew,发布时间为 Dec 13 202。数据集围绕基因组结合/占据谱分析展开,采用高通量测序技术,主题标签涉及 GPL17342 与 4932。

【数据集背景】

该数据集源自 NCBI GEO,源站标题为“Mediator facilitates transcription initiation at most promoters via a Tail-independent mechanism”。从标题可以看出,其研究主题聚焦于 Mediator 复合物在转录起始过程中的作用机制,特别是其是否依赖 Tail 结构来促进大多数启动子的转录起始。源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,表明它是对多个子系列数据的整合汇总。本站将其归入心血管系统疾病 / 主动脉瓣疾病分类,但源站未提供该分类与数据集内容之间关系的进一步说明。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE190778_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签显示其数据类型为“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”,即基于高通量测序的基因组结合/占据谱分析,涉及平台编号 GPL17342 与物种编号 4932。源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,未提供各 SubSeries 的具体内容、样本数量或矩阵字段的详细说明。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 数据库收录的数据集。作者为 Rafal、Donczew,发布时间为 Dec 13 202。源站未提供具体的实验设计、样本采集流程、测序平台细节及数据处理步骤等信息。

【适用场景】

基于主题标签,该数据集适用于基因组结合/占据谱分析相关的高通量测序研究场景,可用于考察 Mediator 在启动子区域转录起始中的作用机制。本站分类将其关联至心血管系统疾病 / 主动脉瓣疾病方向,但源站未提供该关联的具体依据与适用范围的进一步说明。

【使用方法】

可下载数据文件 GSE190778_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。源站未提供更详细的分析流程或参数说明。

【质量与限制】

源站未提供质量控制指标、数据完整性评估或已知偏差的说明。由于该数据集为 SuperSeries,其内容由若干 SubSeries 组成,具体子系列的覆盖范围与数据粒度源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE190778

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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