核糖体碰撞诱导的核糖体降解：核糖体竞争与翻译扰动驱动

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288673

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

催化失活核糖体在起始密码子处的个体停滞触发了核糖体蛋白uS3的泛素化以及随后的18S rRNA降解。尽管翻译延伸过程中核糖体之间的碰撞代表了一种更为广泛的翻译扰动形式，但其对核糖体稳定性的影响仍不清楚。在此，我们阐明了泛素化介导的核糖体周转中的一种分叉，在酵母中鉴定出一条由碰撞诱导的uS3泛素化及小亚基去稳定化分支。该途径不仅清除无功能核糖体，也清除具有原核样解码中心的翻译活跃核糖体，其驱动因素是与野生型核糖体因翻译速率差异而产生的竞争。我们进一步表明，在抗癌药物顺铂和生长阶段转换所触发的翻译扰动下，内源性核糖体亚基化学计量通过泛素化向小亚基短缺状态偏移。这些发现揭示了一种核糖体动态普遍影响核糖体稳定性的机制，提示核糖体功能障碍、异质性及应激相关翻译扰动与小亚基降解有关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。