颅内动脉瘤破裂一致性优先转录组筛查:处理后表格、图表源数据与分析计划
该数据集为一项基于公共 GEO 颅内动脉瘤 RNA-seq 数据的二次分析提供处理后结果,发现阶段使用 GSE122897 瘤壁组织(n=43,22 例破裂 vs 21 例未破裂),采用 DESeq2 与 LM22 校正的差异表达分析,确定预先设定的 300 基因短名单、八基因血液桥接 panel

基本信息
资源简介
颅内动脉瘤破裂一致性优先转录组筛查:处理后表格、图表源数据与分析计划
Processed tables, figure source data, and analysis plan: concordance-first transcriptomic screening for intracranial aneurysm rupture
该数据集为一项基于公共 GEO 颅内动脉瘤 RNA-seq 数据的二次分析提供处理后结果,发现阶段使用 GSE122897 瘤壁组织(n=43,22 例破裂 vs 21 例未破裂),采用 DESeq2 与 LM22 校正的差异表达分析,确定预先设定的 300 基因短名单、八基因血液桥接 panel 和六基因组织破裂核心,并在外部队列中验证。数据包含补充表 S1–S12、Extended Data Table 3、图表绘制数据、TRIPOD/PROBAST 情境检查表及分析计划文档,可用于破裂相关基因标志的复现与验证研究,原始 GEO 数据未包含在内(来源 Zenodo,cc-by-4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026-07-07。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):支持对公共 GEO 颅内动脉瘤 RNA-seq 进行二次分析的处理后结果。发现阶段在 GSE122897 瘤壁组织(n=43;22 例破裂 vs 21 例未破裂)中使用 DESeq2 和 LM22 校正的差异表达,以定义预先设定的 300 基因短名单、一个八基因血液桥接 panel 和一个六基因组织破裂核心,并在外部队列中验证。存放内容包括补充表 S1–S12、Extended Data Table 3、图表绘制数据、TRIPOD/PROBAST 情境检查表以及有记录的分析计划。原始 GEO 数据未包含在内。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 13.86 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.21249929。
【主题与分类】
主题标签:intracranial aneurysm、aneurysm rupture、RNA-seq、GSE122897、gene panel、MPP1、MARCO、supplementary data。本站分类:心血管系统疾病/动脉瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/21249929
使用许可:cc-by-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
curl -L -o "zenodo_deposit.zip" "https://zenodo.org/api/records/21249929/files/zenodo_deposit.zip/content"
文件清单
zenodo_deposit.zip(13.2 MB)
数据集大小约 13.9 MB。
数据说明
支持对公开GEO颅内动脉瘤RNA-seq进行二次分析的处理结果。在GSE122897壁组织(n=43;22例破裂 vs 21例未破裂)中的发现阶段使用DESeq2和LM22校正的差异表达,以确定预先设定的300基因短名单、一个八基因血液桥接panel,以及一个在外部队列中验证的六基因组织破裂核心。数据存放包括补充表S1–S12、扩展数据表3、作图数据、TRIPOD/PROBAST背景检查清单,以及记录在案的分析计划。原始GEO数据未包括在内。
许可
cc-by-4.0
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