野生型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的冷冻电镜结构
该数据集提供了来自野生型淀粉样变性患者心脏组织的淀粉样纤维的高分辨率（3.7埃）冷冻电镜三维结构数据，其数据模态为蛋白质三维坐标与电子密度图，主要用于研究转甲状腺素蛋白在心脏中异常聚集的分子机制，为理解心脏淀粉样变性的病理基础及开发靶向治疗策略提供关键的结构生物学依据。
基本信息
资源简介
野生型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的冷冻电镜结构
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a wild-type amyloidosis patient》。
【数据内容】
源站原始描述：Transthyretin, Amyloidosis, Systemic amyloidosis, ATTR, Cardiac, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.1038/s42003-024-06588-6。
【主题与分类】
主题标签：PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面：https://www.rcsb.org/structure/8E7H
规范引用：Cryo-EM confirms a common fibril fold in the heart of four patients with ATTRwt amyloidosis (2024) Commun Biol
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/8e7h
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- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个公开的冷冻电子显微镜（Cryo-EM）结构数据，解析了来自一名野生型淀粉样变性（ATTRwt）患者心脏组织的淀粉样纤维的三维结构，分辨率达到3.7埃。数据以蛋白质结构文件形式存储，主要包含转甲状腺素蛋白（Transthyretin）形成的病理性纤维的原子坐标信息。该数据通过冷冻电镜技术实验测定，由研究人员Nguyen, B.A和Saelices, L.于2022年8月提交至Protein Data Bank Japan（PDBj），并于2023年8月公开发布。该数据集主要用于研究心脏淀粉样变性的分子病理机制、蛋白质错误折叠与聚集的规律，并为相关药物设计与结构生物学研究提供关键的结构基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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