人免疫球蛋白轻链可变区ASLTVS片段(残基73-78)组装淀粉样纤维结构数据集
该数据集包含人免疫球蛋白轻链可变区中ASLTVS片段(残基73-78)组装形成的淀粉样纤维的三维结构数据,属于蛋白质结构模态,通过X射线衍射方法测定,主要用于研究系统性轻链淀粉样变性中淀粉样纤维形成的结构基础,为疾病机制解析和靶向治疗开发提供关键实验依据。

基本信息
资源简介
人免疫球蛋白轻链可变区ASLTVS片段(残基73-78)组装淀粉样纤维结构数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ASLTVS segment from Human Immunoglobulin Light-Chain Variable Domain, Residues 73-78, assembled as an amyloid fibril》。
【数据内容】
源站原始描述:amyloid fibril, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1074/jbc.RA118.004142。
【主题与分类】
主题标签:PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/6DJ0
规范引用:Identification of two principal amyloid-driving segments in variable domains of Ig light chains in systemic light-chain amyloidosis. (2018) J. Biol. Chem
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/6dj0
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个蛋白质结构数据集,包含人免疫球蛋白轻链可变区(Lambda Mcg)中ASLTVS片段(残基73-78)组装形成的淀粉样纤维的高分辨率三维结构。数据通过X射线衍射方法测定(分辨率为1.3埃),由Brumshtein、Esswein、Sawaya和Eisenberg等研究人员于2018年提交并发布。该数据集来源于蛋白质结构数据库(PDBj),主要用于研究系统性轻链淀粉样变性中驱动淀粉样纤维形成的关键肽段结构,为理解淀粉样蛋白聚集机制、疾病病理及药物设计提供结构基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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