B构象lambda 3轻链AL淀粉样蛋白纤维结构数据集
该数据集包含通过冷冻电子显微镜解析的、来自AL淀粉样变性病患者的lambda 3轻链蛋白片段形成的淀粉样蛋白纤维的三维结构数据，其结构模态为原子坐标数据，主要用于研究蛋白质错误折叠疾病的分子机制、淀粉样纤维的结构特征，并为相关疾病的药物设计与靶点发现提供结构基础。
基本信息
资源简介
B构象lambda 3轻链AL淀粉样蛋白纤维结构数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《AL amyloid fibril from a lambda 3 light chain in conformation B》。
【数据内容】
源站原始描述：amyloid fibril, antibody, beta sheet, heart, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.1038/s41467-021-21126-2。
【主题与分类】
主题标签：PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面：https://www.rcsb.org/structure/6Z1I
规范引用：Cryo-EM reveals structural breaks in a patient-derived amyloid fibril from systemic AL amyloidosis. (2021) Nat Commun
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/6z1i
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了从系统性AL淀粉样变性病患者体内分离出的lambda 3轻链片段（残基2-116）在B构象下形成的淀粉样蛋白纤维的高分辨率结构数据。数据通过冷冻电子显微镜技术解析，分辨率达到3.4埃，揭示了该病理蛋白纤维的原子级三维结构。该数据集来源于PDBj（Protein Data Bank Japan）数据库，收录编号为6z1i，主要应用于结构生物学、蛋白质错误折叠疾病机制研究、药物靶点发现以及淀粉样变性病的分子病理学分析等领域。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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