PRJNA1207041:腹主动脉瘤发病机制相关转录组变化
该数据集来自 NCBI,聚焦腹主动脉瘤发病机制相关的转录组变化。研究在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立 Angiotensin II(Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对呈现不同严重程度的腹主动脉组织进行基因表达谱分析

基本信息
资源简介
PRJNA1207041:腹主动脉瘤发病机制相关转录组变化
PRJNA1207041 数据集聚焦于腹主动脉瘤发病机制相关的转录组变化,来源于 NCBI。该研究在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立血管紧张素 II(Angiotensin II,Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对呈现不同严重程度的腹主动脉组织进行基因表达谱分析,从而获得与疾病发生发展相关的基因表达信息。数据集归类于心血管系统疾病中的腹主动脉瘤方向,主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),可为探索腹主动脉瘤发病机制的研究提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
腹主动脉瘤是心血管系统疾病的重要类型之一。该数据集围绕腹主动脉瘤的发病机制展开,采用低密度脂蛋白受体缺陷小鼠作为实验动物,通过 Angiotensin II(Ang II)诱导建立腹主动脉瘤模型。这一模型设计将脂质代谢异常背景与 Ang II 诱导因素结合,用于观察腹主动脉瘤形成过程中腹主动脉组织的转录组改变。数据集所关注的核心问题是与腹主动脉瘤发病机制相关的基因表达变化,尤其是不同严重程度病变组织之间的表达谱差异。
【数据内容】
该数据集的主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),即数据主体为测序产生的原始序列读段。研究对呈现不同严重程度的腹主动脉组织进行基因表达谱分析,因此数据内容对应腹主动脉瘤模型中不同病变严重程度腹主动脉组织的转录组测序结果。数据集英文名称为“PRJNA1207041: Transcriptomic change related to abdominal aortic aneurysm pathogenesis”,表明其内容主题是腹主动脉瘤发病机制相关的转录组变化。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据量等更具体的内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。根据源站描述,研究在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立 Angiotensin II(Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对腹主动脉组织进行基因表达谱分析,所分析的组织表现出不同程度的疾病严重程度。数据由原始序列读段构成,属于转录组测序数据。关于样本采集的具体时间、地点、操作流程以及测序服务的具体提供方等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于腹主动脉瘤发病机制相关的转录组研究,例如比较不同严重程度腹主动脉病变组织之间的基因表达差异,寻找与疾病进展相关的表达变化特征。由于数据以原始序列读段形式提供,适合作为转录组分析流程的输入数据,用于基因表达定量、差异表达分析等下游分析。此外,该数据集基于低密度脂蛋白受体缺陷小鼠的 Ang II 诱导模型,可用于围绕该动物模型的腹主动脉瘤转录组特征开展研究。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始序列读段(Raw sequence reads)形式提供,使用时可按照转录组测序数据的常规处理方式,先进行读段质量控制与预处理,再开展比对、表达定量及差异表达等分析。由于研究涉及不同严重程度的腹主动脉组织,分析时可依据样本的严重程度分组进行比较。关于数据的具体下载方式、文件组织格式以及是否附带预处理数据或分析结果,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI,主题标签为原始序列读段,说明提供的是未经下游处理的原始测序数据,使用前需要自行完成质量控制与生物信息学处理。研究基于低密度脂蛋白受体缺陷小鼠的 Ang II 诱导腹主动脉瘤模型,其结果与人类腹主动脉瘤之间的对应关系需谨慎对待。关于数据质量评估指标、样本量、测序深度、是否存在批次效应等具体质量信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI,英文名称为“PRJNA1207041: Transcriptomic change related to abdominal aortic aneurysm pathogenesis”。关于该数据集的引用方式、许可条款及使用限制,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1207041
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立了血管紧张素II(Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对表现出不同严重程度的腹主动脉组织中的基因表达谱进行了分析。
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