PRJNA1196699：小鼠腹主动脉瘤 RNA-Seq 数据集
该数据集为 NCBI BioProject 编号 PRJNA1196699 的小鼠腹主动脉瘤 RNA-Seq 数据，属于心血管系统疾病下的腹主动脉瘤研究方向，主题标签为 Raw sequence reads
基本信息
资源简介
PRJNA1196699：小鼠腹主动脉瘤 RNA-Seq 数据集
PRJNA1196699 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的小鼠腹主动脉瘤 RNA-Seq 数据集，属于心血管系统疾病分类下的腹主动脉瘤研究方向。该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其核心内容为原始测序读段。BioProject 是围绕某一项研究计划或项目而汇集的一组生物学数据，通常来源于单一机构或联合体；每条 BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种类型数据。因此，PRJNA1196699 可作为获取该小鼠腹主动脉瘤 RNA-Seq 项目相关数据资源的入口记录，便于研究者定位和访问对应的原始序列数据。
【数据集背景】
腹主动脉瘤是心血管系统疾病中的一种重要病症，其发生发展涉及复杂的分子机制。该数据集以小鼠为研究对象，采用 RNA-Seq 技术获取转录组层面的原始测序数据，归属于 NCBI BioProject 体系下的一个具体项目。BioProject 的设计目标是将与单一研究计划相关的生物学数据集中管理，并链接到由该项目产生的多种数据类型，从而为数据发现和再利用提供便利。该数据集所在的分类为心血管系统疾病 / 腹主动脉瘤，说明其服务于该疾病方向的研究。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读段。这意味着数据内容以测序仪直接产出的读段形式为主，而非经过比对、定量或注释后的加工数据。作为 RNA-Seq 数据集，其原始读段可用于后续的转录组分析流程。源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、测序深度、组织类型或具体处理条件等更细粒度的信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1196699 - BioProject - NCBI”。其英文名称为 PRJNA1196699: Mouse abdominal aortic aneurysm RNA-Seq Dataset。数据由 NCBI BioProject 收录，BioProject 记录本身来源于单一机构或联合体所发起的研究计划。源站未提供具体的样本采集地点、时间、实验操作细节或机构名称等信息。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病中腹主动脉瘤方向的转录组研究，尤其是需要从原始测序读段出发进行自主分析的用户。由于主题标签为 Raw sequence reads，它可用于重新比对、转录本组装、表达定量、差异表达分析等下游处理流程。同时，作为 BioProject 记录，它也可作为查找该项目相关多种数据类型的入口。源站未提供关于具体适用分析类型或研究设计的进一步说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以编号 PRJNA1196699 检索并访问该记录。BioProject 记录提供指向该项目所产生各类数据的链接，用户可据此定位原始序列读段及其他相关数据。源站未提供关于数据下载格式、文件大小、处理工具或分析流程的具体指引。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，其描述强调 BioProject 是相关生物学数据的集合，并提供查找多种数据类型的统一入口。主题标签为 Raw sequence reads，表明数据为原始读段，通常需要用户自行进行质量控制与后续处理。源站未提供关于数据质量评估、污染控制、批次效应或技术偏差等方面的具体信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可条款或使用限制等信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1196699
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为探究不同处理条件下（高脂饮食/标准饮食+血管紧张素II/生理盐水）小鼠主动脉组织的转录组变化，以揭示腹主动脉瘤的分子机制。小鼠模型有助于验证人体研究的发现，并评估实验条件对腹主动脉瘤进展的影响，从而促进病因学研究和药物研发。在高脂饮食+血管紧张素II组中鉴定出超过3，000个差异表达基因，富集于中性粒细胞活化、中性粒细胞胞外诱捕网形成及铁代谢相关通路（如S100A8、IL1B、HBA-A1）。与其他组相比，该组表现出更严重的病理特征。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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