PRJNA1146589：CRP沉积腹主动脉瘤全转录组分析
该数据集来自 NCBI，为腹主动脉瘤（AAA）中 C 反应蛋白（CRP）沉积影响血管壁微环境的全转录组分析原始测序数据。研究通过检测巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞等特定细胞类型的基因表达谱，探索参与 AAA 进展与加重的通路
基本信息
资源简介
PRJNA1146589：CRP沉积腹主动脉瘤全转录组分析
PRJNA1146589 数据集来自 NCBI，主题为腹主动脉瘤（AAA）中 C 反应蛋白（CRP）沉积影响血管壁微环境的全转录组分析，属于心血管系统疾病 / 腹主动脉瘤分类。该研究旨在探究 CRP 沉积影响腹主动脉瘤血管壁微环境的分子机制，通过检测巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞等特定细胞类型的基因表达谱，寻找参与 AAA 进展与加重的通路。数据集内容为原始测序读段（Raw sequence reads），可为研究 AAA 相关细胞类型转录组变化提供原始数据基础。
【数据集背景】
腹主动脉瘤是一种心血管系统疾病。该数据集所对应的研究关注 C 反应蛋白（CRP）沉积对腹主动脉瘤血管壁微环境的影响，目标是阐明其中的分子机制。研究特别着眼于血管壁内特定细胞类型的基因表达变化，包括巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞，并试图据此揭示参与 AAA 进展和加重的通路。这一背景决定了数据集的核心价值在于支持从全转录组层面考察 CRP 沉积与 AAA 微环境之间的关系。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始测序读段。其内容属于全转录组分析产生的原始测序数据，用于检测特定细胞类型的基因表达谱。研究覆盖的细胞类型包括巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据量、文件格式等更具体的数据内容说明。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJNA1146589: Whole transcriptomic analysis of CRP deposited abdominal aortic aneurysm”。其数据来自针对 CRP 沉积的腹主动脉瘤组织所开展的全转录组分析。关于样本采集地点、采集时间、供体信息、伦理审批等具体采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究腹主动脉瘤中 CRP 沉积对血管壁微环境影响的分子机制，尤其适合分析巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞等特定细胞类型的基因表达谱，并探索与 AAA 进展和加重相关的通路。由于数据形式为原始测序读段，也可作为转录组数据再分析的原始输入。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
该数据集为原始测序读段，使用前通常需要进行读段质量控制、比对或定量等转录组数据处理步骤，以获取特定细胞类型的基因表达谱。关于该数据集的具体处理流程、推荐参数和分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为原始测序读段，尚未提供经过处理的表达矩阵或分析结果。关于数据质量指标、测序深度、重复数、批次信息以及潜在偏差等，源站未提供。使用时应以原始读段为基础自行开展质量控制与处理。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，英文名称为“PRJNA1146589: Whole transcriptomic analysis of CRP deposited abdominal aortic aneurysm”。关于引用方式、许可条款和使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1146589
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探究C反应蛋白（CRP）沉积影响腹主动脉瘤（AAA）血管壁微环境的分子机制。通过检测特定细胞类型（包括巨噬细胞、淋巴细胞和血管平滑肌细胞）内的基因表达谱，该研究试图阐明促进AAA进展和加重的通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
