LG/J与SM/J高级互交系小鼠外耳组织再生数量性状位点精细定位数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.vc473

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数据集大小约 132.4 KB。

数据说明

LG/J小鼠的外耳孔闭合是一种再生反应模型，伴随着类芽基结构的形成以及包括软骨在内的多种组织的再生长。组织再生的能力是可遗传的。为了鉴定在30天愈合期内参与耳孔闭合的基因组位点，我们构建了小鼠的F34高级互交系（Wustl:LG,SM-G34）。我们定位了19个与耳孔闭合相关的数量性状位点（QTL）。单个基因效应相对较小（0.08毫米），且大多数位点具有共显性效应，杂合子表型居中。QTL支持区域的中位大小为2 Mb，包含中位数为19个基因。我们通过比较LG/J和SM/J愈合组织间的差异转录表达、功能分析以及针对感兴趣的位置候选基因及其周围SNPs的生物信息学分析，对位置候选基因进行了评估。对34个位置候选基因集合及显示表达差异的基因进行分析，揭示了参与细胞周期调控/DNA损伤、细胞迁移与黏附、发育相关基因以及代谢的基因存在过度表达。

这表明LG/J小鼠的愈合表型涉及多种生理机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。