多组学视角下铁死亡相关基因在慢性肾脏病中的作用
所有分析数据均为去标识化的汇总级公共遗传数据集,不含个体人类临床原始样本,符合隐私与伦理法规。数据来源包括四个主要开放获取数据库:1)FerrDB V2,提供564个已验证的铁死亡相关基因;2)来自独立欧洲人群队列的血液多组学QTL汇总数据(mQTL、eQTL、pQTL)(mQTL荟萃分析队列、eQ

基本信息
资源简介
多组学视角下铁死亡相关基因在慢性肾脏病中的作用
所有分析数据均为去标识化的汇总级公共遗传数据集,不含个体人类临床原始样本,符合隐私与伦理法规。数据来源包括四个主要开放获取数据库:1)FerrDB V2,提供564个已验证的铁死亡相关基因;2)来自独立欧洲人群队列的血液多组学QTL汇总数据(mQTL、eQTL、pQTL)(mQTL荟萃分析队列、eQ
The Role of Ferroptosis-Related Genes in Chronic Kidney Disease from a Multi-Omics Perspective.
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集支持题为《The Role of Ferroptosis-Related Genes in Chronic Kidney Disease》(Zhiqi Liu,郑州大学)的硕士学位论文。所有分析数据均为去标识化的汇总级公共遗传数据集,不含个体人类临床原始样本,符合隐私与伦理法规。数据来源包括四个主要开放获取数据库:1)FerrDB V2,提供564个已验证的铁死亡相关基因;2)来自独立欧洲人群队列的血液多组学QTL汇总数据(mQTL、eQTL、pQTL)(mQTL荟萃分析队列、eQTLGen联盟、Pietzner血浆蛋白质组GWAS);3)CKD GWAS汇总统计(发现队列GCST008064,验证队列FinnGen R10);4)GTEx V8肾皮质eQTL数据与GEO GSE66494肾活检转录组数据,用于组织验证。所有分析流程均采用基于汇总数据的孟德尔随机化(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)、col
【主题与分类】
主题标签:慢性肾脏病、铁死亡相关基因、多组学、孟德尔随机化、QTL、GWAS、肾脏皮质。本站分类:泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.21287135
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
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数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21287135
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 3.3 MB。
数据说明
本数据集支撑硕士学位论文《铁死亡相关基因在慢性肾脏病中的作用》(刘志奇,郑州大学)。所有分析数据均为去标识化的汇总级公开遗传数据集,不包含个体人类临床原始样本,符合隐私与伦理规范。数据来源包括四大开放获取数据库:1) FerrDB V2,提供564个经验证的铁死亡相关基因;2) 来自独立欧洲人群队列的血液多组学QTL汇总数据(mQTL、eQTL、pQTL)(mQTL荟萃分析队列、eQTLGen联盟、Pietzner血浆蛋白质组GWAS);3) CKD GWAS汇总统计量(发现队列GCST008064,验证队列FinnGen R10);4) GTEx V8肾皮质eQTL数据及GEO GSE66494肾活检转录组数据,用于组织验证。所有分析流程均采用基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)、共定位分析及Wilcoxon差异表达检验。
关键变量包括SNP遗传变异、CpG甲基化探针、基因ID、血浆蛋白标志物、SMR统计指标(P-SMR、P-SMR-multi、P-HEIDI)、比值比(OR)、FDR、PPH4共定位后验概率,以及CKD/对照肾组织的基因表达值。本数据集压缩包附有README文件,详细说明了完整的数据库登录号、数据下载链接、统一的R/SMR软件参数、统计阈值、基因注释表以及结果表逐列变量解释,以供可重复再分析。
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