癌症多组学基准数据集

大规模癌症多组学基准数据集,整合TCGA数据,覆盖32种癌症,含20个多组学数据集,用于个性化癌症治疗的机器学习研究。

京都大学生物信息学中心,日本京都大学生物信息学中心,日本
arXiv
2024-09-03 更新
浏览 21
多模态癌症多组学

基本信息

模态
多模态
创建/更新时间
2024-09-03

资源简介

CMOB是由京都大学和Osaka大学创建的大规模癌症多组学基准数据集,整合了TCGA平台数据资源,包含20个多组学数据集,覆盖32种癌症类型,经过系统处理,旨在通过机器学习推动个性化癌症治疗。

原始链接

https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark

arXiv 论文 →
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使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

Installation

git clone https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark
cd Cancer-Multi-Omics-Benchmark

conda create -n mlomics python=3.11
conda activate mlomics
pip install -r requirements.txt




> 完整仓库:[github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark](https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark)

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