癌症多组学基准数据集

大规模癌症多组学基准数据集,整合TCGA数据,覆盖32种癌症,含20个多组学数据集,用于个性化癌症治疗的机器学习研究。

京都大学生物信息学中心,日本京都大学生物信息学中心,日本
arXiv
2024-09-03 更新
浏览 45
多模态癌症多组学
Cancer Multi-Omics Benchmark (CMOB)

基本信息

模态
多模态
大小
0.02 GB
创建/更新时间
2024-09-03
版本
main

资源简介

癌症多组学基准数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark》。源站首次发布:2024-06-06。

【数据内容】

源站原始描述:# MLOmics: Cancer Multi-Omics Database for Machine Learning **A standardized benchmark and toolkit for cancer multi-omics machine learning.** | Datasets | Cancer types | Patients | Omics | Baselines | Venue | |:-:|:-:|:-:|:-:|:-:|:-:| | **20** | **32** | **8,314** | **4** (mRNA, miRNA, Methy, CNV) | **10+** | Scientific Data | Paper · Project Page · Hugging Face - 📢 **Update (July 2026):** MLOmics resources have been refreshed based on community feedback. Thank you…

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-07-27,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

Installation

git clone https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark
cd Cancer-Multi-Omics-Benchmark

conda create -n mlomics python=3.11
conda activate mlomics
pip install -r requirements.txt




> 完整仓库:[github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark](https://github.com/chenzRG/Cancer-Multi-Omics-Benchmark)

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