急性感染性疾病生物样本库

数据集获取

源站：https://escience.org.cn/metadata/detail?cstrId=CSTR:17621.07.B1004&id=1f1f877df2c503dd9ff4d7033e6b1026:B1004

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集是一个针对急性感染性疾病的生物样本资源库，主要收集2009年以来中国南方省区（广东、湖南、广西、海南）的急性感染病例样本。样本类型包括呼吸道拭子、肠道拭子、深部痰、肺灌洗液、粪便、脑脊液和血清等感染部位样本。所有样本均通过分离培养、分子生物学和免疫学方法进行病原筛查与确认，并结合完整的病例记录、影像学资料、病原学（含耐药表型）信息，部分病例还包含对应的毒株、菌株及分子流行病学数据。该资源库旨在研究南方地域特征的急性感染性疾病流行病原谱、新发突发传染病重要病原，为临床实验室病原诊断方法的设计与评估提供实验材料。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。