生物信息学识别动静脉内瘘成熟的预测因子
该数据集整合了三个动静脉内瘘(AVF)相关的基因表达数据集,通过生物信息学方法(如基因本体富集分析和差异表达基因分析)探究AVF成熟过程中的分子机制,重点关注炎症与免疫反应通路,并识别了与性别差异和糖尿病状态相关的生物标志物,旨在为改善血液透析中AVF的通畅性和成熟率提供新的研究方向和潜在治疗靶点。

基本信息
资源简介
生物信息学识别动静脉内瘘成熟的预测因子
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Bioinformatics Identifies Predictors of Arteriovenous Fistula Maturation》。源站首次发布:2021-03-02。
【数据内容】
源站原始描述:Arteriovenous fistulae (AVF) are the preferred access for hemodialysis but still have poor rates of maturation and patency limiting their clinical use. The underlying mechanisms of venous remodeling remain poorly understood, and only limited numbers of unbiased approaches have been reported. Biological Gene Ontology (GO) term enrichment analysis and differentially expressed genes (DEG) analysis were performed for three AVF datasets. A microRNA enrichment analysis and L1000CDS2 query were perform…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 13.42 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.4557696。
【主题与分类】
主题标签:Arteriovenous fistulae、GO for biological processes、inflammation、diabetes、sex difference。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/4557696
使用许可:cc-by-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/record/4557696
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数据说明
该数据集旨在研究动静脉内瘘(AVF)成熟过程中的分子机制,以识别预测AVF通畅性的生物标志物。数据集整合了三个AVF相关的基因表达数据集,通过基因本体(GO)富集分析、差异表达基因(DEG)分析、microRNA富集分析和L1000CDS2查询等方法,探究了炎症和免疫反应在AVF成熟早期和晚期的作用。研究发现,在AVF成熟过程中,中性粒细胞和白细胞调节、细胞因子产生及信号传导等通路被激活;男性AVF失败患者中,髓系-白细胞分化的负调控和巨噬细胞激活调控显著上调;糖尿病患者则表现出免疫反应相关通路的减弱。这些结果揭示了AVF成熟相关的基因协调与差异调控,为改善性别特异性AVF成熟提供了新的分子靶点。
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