皮肌炎患者与COVID-19感染共享部分相似转录组特征
该数据集包含皮肌炎患者皮肤样本的转录组数据（基因表达模态），通过生物信息学分析比较了皮肌炎与COVID-19感染患者的转录特征，识别出MX1、ISG15、IFIT3等关键基因作为潜在生物标志物，主要用于探究自身免疫疾病与病毒感染的分子关联，支持皮肌炎的早期诊断、治疗靶点发现及免疫机制研究。
基本信息
资源简介
皮肌炎患者与COVID-19感染共享部分相似转录组特征
【一句话概览】
研究发现，皮肌炎患者皮肤与COVID-19患者皮肤具有相似的转录谱。皮肌炎是一种主要累及皮肤和骨骼肌的自身免疫病，病毒感染及I型干扰素相关信号通路在其发病中起重要作用。该研究基于生物信息学分析识别出皮肌炎的关键基因，包括MX1、ISG15、IFIT3、IFIT1、RSAD2、IFIT2、IFI6、XAF1、IRF9、MX2，这些枢纽基因可能作为皮肌炎早期诊断和治疗的潜在生物标志物（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Patients with dermatomyositis shared partially similar transcriptome signature with COVID-19 infection》。配套论文《Patients with dermatomyositis shared partially similar transcriptome signature with COVID-19 infection》发表于 Autoimmunity（2023），DOI：10.1080/08916934.2023.2220984。项目资助方：This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 81901664, 82070018, 82270097), the Natural Science Foundation of Hunan Province (2020JJ5894).。源站首次发布：2023-06-24。
【数据内容】
源站原始描述：Dermatomyositis (DM) is an autoimmune disease that primarily affects the skin and skeletal muscle. Virus infection and type I interferon-related signaling pathways play an important role in the pathogenesis of dermatomyositis. In this study, we found that the skin of patients with DM and the skin of patients with COVID-19 have similar transcriptional profiles, and identified key genes involved in dermatomyositis based on bioinformatics analysis. These hub-genes might be served as potential bioma…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：皮肌炎（DM）是一种主要累及皮肤和骨骼肌的自身免疫性疾病。病毒感染和I型干扰素相关信号通路在皮肌炎的发病机制中发挥重要作用。在本研究中，我们发现DM患者的皮肤与COVID-19患者的皮肤具有相似的转录谱，并基于生物信息学分析鉴定了参与皮肌炎的关键基因。这些枢纽基因可能作为DM早期诊断和治疗的潜在生物标志物，包括MX1、ISG15、IFIT3、IFIT1、RSAD2、IFIT2、IFI6、XAF1、IRF9、MX2。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 34.10 KB。ST1.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，17.21 KB。ST2.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，16.89 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.23573933.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Space Science、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签：Dermatomyositis、COVID-19、skin、bioinformatics analysis。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Space Science、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Patients_with_dermatomyositis_shared_partially_similar_transcriptome_signature_with_COVID-19_infection/23573933
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Patients with dermatomyositis shared partially similar transcriptome signature with COVID-19 infection. Taylor & Francis. Yang, Yiying; Song, Jie; Zhao, Hongjun; Zhang, Huali; Guo, Muyao
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-10，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于自身免疫性疾病皮肌炎（DM），通过转录组分析探究其与COVID-19感染的分子关联。数据集包含皮肌炎患者皮肤样本的转录组数据，采用生物信息学方法（如差异表达分析和关键基因筛选）识别了皮肌炎与COVID-19患者皮肤中相似的转录特征，并发现MX1、ISG15、IFIT3等10个关键基因可能作为皮肌炎早期诊断和治疗的潜在生物标志物。研究旨在揭示病毒感染与I型干扰素信号通路在皮肌炎发病机制中的作用，为自身免疫疾病的分子机制研究和临床生物标志物发现提供数据支持。
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