GSE53224肾母细胞瘤样本表达谱
GSE53224包含53例肾母细胞瘤样本Affymetrix表达谱，适合肿瘤异质性、分型、基因签名和验证分析。 该数据集与肾母细胞瘤密切相关，包含表格数据，可用于分类、表型抽取、特征筛选和临床研究验证。
基本信息
资源简介
GSE53224肾母细胞瘤样本表达谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene expression data from Wilms tumor samples》。源站首次发布：Dec 11 201。
【数据内容】
源站原始描述：Wilms tumor (nephroblastoma) is a pediatric kidney tumor that arises from renal progenitor cells. Since the blastemal type is associated with adverse prognosis, we characterized such Wilms tumors by exome and transcriptome analysis. We detected novel, recurrent somatic mutations affecting the SIX1/2 – SALL1 pathway implicated in kidney development, the DROSHA/DGCR8 microprocessor genes as well as alterations in MYCN and TP53, the latter being strongly associated with dismal outcome. The DROSHA m…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53224
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53224
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE53224包含53例肾母细胞瘤样本Affymetrix表达谱，适合肿瘤异质性、分型、基因签名和验证分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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