Bladder Urothelial Carcinoma TCGA PanCancer Atlas
cBioPortal urothelial carcinoma data with mutation, CNA, expression, and clinical profiles for comparator analyses.
基本信息
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cBioPortal urothelial carcinoma data with mutation, CNA, expression, and clinical profiles for comparator analyses.
https://www.cbioportal.org/study/summary?id=blca_tcga_pan_can_atlas_2018
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.cbioportal.org/study/summary?id=blca_tcga_pan_can_atlas_2018
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
cBioPortal提供尿路上皮癌突变、拷贝数、表达和临床数据，可用于输尿管癌相关通路、驱动基因和分型对照研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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